Optional profiling
まだ誰も着手していません。
評価
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 初心者へのやさしさ
- 35/100
- issue の種類
- 機能追加
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 活発さ
- 停滞
- 技術スタック
- cpp
- 領域
- cli, performance
調査の方向性
コンパイル済みモデルのサンプリングのエントリーポイントと CmdStan の profiling 処理から始めます。この issue では具体的なファイルやテストは指定されていません。要求されている profile=FALSE/TRUE の動作を文書化された workaround と比較し、Stan プログラムを手動で編集したり、モデルの 2 つ目のバージョンを維持したりせずに、サンプリングで profiling をスキップできることを確認します。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Profiling is a great tool for debugging and performance optimization, but it also adds a bit of overhead to the execution of the Stan program. So it would be nice to skip the profiling statements whenever you don't need them and want the model to run as fast as possible - without the need to manually remove them from the stan program or to always keep two version of the same program (one with and one without profiling statements).
Ideal solution
Ideally, there would be an additonal profile = FALSE/TRUE argument to the sample function of a compiled stan model that would be passed on to CmdStan.
Workaround
As a workaround, one can automatically create a temporary copy of the stan program with all profiling statements removed, compile this temporary copy, and sample from this model without profiling. This requires no changes to CmdStan. The disadvantage is of course that this requires a second compiling of the stan model.
I have implemented this workaround as a wrapper of cmdstan_model in this repo. We have been using it during the development work for epinowcast and it has been quite robust. It also supports included files. It would also be possible to use this workaround for a profile = FALSE/TRUE argument in the sample function.
Context
Regarding the ideal solution of integrating this functionality with CmdStan, I lack the expertise to judge how difficult that would be and probably could not do it myself. If people think a workaround like above is acceptable, I'm happy to help implementing it for cmdstanr, but would need some guidance (and a few details still need to be sorted out).
- 主要言語
- C++
- スター
- 240
- フォーク
- 105
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
環境構築
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートあり
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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