Cannot disable verbose output on HPC - maybe use if (missing(verbose)) instead?
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評価
調査の方向性
まず、リンク先の R/runSimulation.R と R/runArraySimulation.R にある verbose の処理を読んでください。デフォルト値が明示的に指定された verbose = FALSE とどのように作用するかを確認し、issue で提案されている2つの代替案を比較してください。呼び出し側がこの出力を明示的に抑制でき、デフォルトの動作が HPC の実行に引き続き適切であれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Hi, I started to get check errors when I run reverse dependency checks on an HPC environment.
I'm using [runSimulation(..., verbose = FALSE)](https://github.com/futureverse/progressify/blob/c643ed257ace0875eb987555441c7f43a35309ab/inst/testme/test-progressify-SimDesign.R#L24-L26) in my checks, by verbose = FALSE` is ignored by SimDesign 2.27.
I tracked it down to:
Right now I cannot disable such output without hiding certain env vars from SimDesign.
Maybe an alternative approach would be to use:
if(missing(verbose)) verbose <- on_HPC.cluster()
Or, setting the default argument to verbose = interactive() || on_HPC.cluster()?
- 主要言語
- R
- スター
- 65
- フォーク
- 25
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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