openforcefield/openff-interchange

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• MDConfig.write_mdp_file emits invalid rvdwswitch key

  オープン

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  難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 85/100

  openforcefield/openff-interchange#1555 · 2026年10月30日 に作成

  メンテナーはふだん 1 日以内に返信

• MDConfig.apply fails for valid non-periodic Interchange objects

  オープン

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  難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 85/100

  openforcefield/openff-interchange#1554 · 2026年10月30日 に作成

  メンテナーはふだん 1 日以内に返信

• Interchange.combine silently accepts unequal periodic box vectors

  オープン

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 70/100

  openforcefield/openff-interchange#1553 · 2026年10月30日 に作成

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• Plans for ingesting an mBuild Compound into Interchange?

  再び着手できるかも @j-wags が 81 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  openforcefield/openff-interchange#1524 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 · 2026年8月10日 に作成

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• Virtual site example is somewhat flaky

  オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 22/100

  openforcefield/openff-interchange#1518 · 2026年7月17日 に作成

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• Update (most) tests to use Sage 2.3.0

  再び着手できるかも @mattwthompson が 81 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  good first issue

  openforcefield/openff-interchange#1517 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 · 2026年7月15日 に作成

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• Investigate flaky tests

  再び着手できるかも @mattwthompson が 219 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  openforcefield/openff-interchange#1471 · 担当者 1 名 · 2026年3月25日 に作成

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• Separate proper and improper torsions into different OpenMM forces?

  オープン

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  feedback needed openmm

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  openforcefield/openff-interchange#1447 · 2026年2月25日 に作成

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• `ConstraintsCollection` always added, even when empty

  オープン

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 52/100

  openforcefield/openff-interchange#1432 · リアクション 1 件 · 2026年2月19日 に作成

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• Remove (this) packmol wrapper

  オープン

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  good first issue system preparation

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 20/100

  openforcefield/openff-interchange#1428 · 2026年2月12日 に作成

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• Deprecate (this) Packmol wrapper

  オープン

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  good first issue system preparation

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  openforcefield/openff-interchange#1427 · 2026年2月12日 に作成

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• Some orders of imported component combination fail

  オープン

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  難易度 4/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

  openforcefield/openff-interchange#1422 · 2026年2月3日 に作成

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• Improve example runtime

  再び着手できるかも @mattwthompson が 338 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  amber documentation gromacs openmm polymer-performance

  openforcefield/openff-interchange#1379 · 担当者 1 名 · 2025年11月26日 に作成

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• Bump dependencies in docs environment

  オープン

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  dependencies good first issue

  難易度 1/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 57/100

  openforcefield/openff-interchange#1367 · 2025年11月6日 に作成

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• Missing PBC in bonded forces when using to_openmm_simulation causes large energies in polymers

  オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

  openforcefield/openff-interchange#1335 · コメント 10 件 · リアクション 1 件 · 2025年9月21日 に作成

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• Debug NAGL example assignment time

  オープン

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  polymer-performance

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

  openforcefield/openff-interchange#1311 · 2025年8月23日 に作成

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• Improve `Interchange.combine` tests

  オープン

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

  openforcefield/openff-interchange#1300 · コメント 1 件 · 2025年8月14日 に作成

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• Fix "slow" test configuration

  オープン

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 48/100

  openforcefield/openff-interchange#1287 · 2025年8月7日 に作成

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• Consider renaming `EnergyReport.compare`

  オープン

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  openforcefield/openff-interchange#1284 · 2025年7月30日 に作成

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• Make `Interchange.topology` read-only

  再び着手できるかも @mattwthompson が 403 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  openforcefield/openff-interchange#1282 · コメント 2 件 · 担当者 1 名 · 2025年7月29日 に作成

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• Improve interoperability testing on systems containing biopolymers

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 15/100

  openforcefield/openff-interchange#1281 · 2025年7月29日 に作成

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• Improve runtime performance on systems containing biopolymers

  オープン

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  polymer-performance

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 15/100

  openforcefield/openff-interchange#1280 · 2025年7月29日 に作成

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• Standardize warnings about ff14SB port in examples

  オープン

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 35/100

  openforcefield/openff-interchange#1258 · 2025年7月10日 に作成

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• Look into GROMACS dispersion correction reporting

  オープン

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 38/100

  openforcefield/openff-interchange#1247 · 2025年7月7日 に作成

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• Improve discoverability within docs

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  openforcefield/openff-interchange#1236 · 2025年6月3日 に作成

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• Interchange 1.0

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 15/100

  openforcefield/openff-interchange#1416 · 2025年6月1日 に作成

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• Dealing with massless atoms in `Interchange.from_openmm`

  オープン

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  feedback needed help wanted openmm virtual sites

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  openforcefield/openff-interchange#1217 · コメント 2 件 · リアクション 1 件 · 2025年5月12日 に作成

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• More `Interchange.from_openmm` virtual site features

  オープン

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  openmm virtual sites

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  openforcefield/openff-interchange#1214 · 2025年5月12日 に作成

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• Should `Interchange.minimize` also modify topology positions?

  再び着手できるかも @mattwthompson が 480 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  interchange-1.0

  openforcefield/openff-interchange#1202 · コメント 2 件 · 担当者 1 名 · 2025年4月16日 に作成

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• Think about hijacking atom metadata for virtual site bookkeepping

  オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

  openforcefield/openff-interchange#1201 · 2025年4月15日 に作成

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• Flaky double exponential tests

  オープン

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  openforcefield/openff-interchange#1190 · 2025年3月21日 に作成

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• Support `openmm.RBTorsionForce` in `Interchange.from_openmm`

  オープン

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  openmm

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

  openforcefield/openff-interchange#1184 · 2025年3月11日 に作成

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• Test stability of serialized representations

  オープン

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  openforcefield/openff-interchange#1181 · 2025年3月5日 に作成

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• Write `[ constraints ]` directive

  オープン

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  feedback needed gromacs help wanted

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

  openforcefield/openff-interchange#1180 · コメント 12 件 · 2025年3月4日 に作成

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• `Constraints` collection is not treated when writing GROMACS topology

  再び着手できるかも @mattwthompson が 606 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  gromacs

  openforcefield/openff-interchange#1178 · コメント 5 件 · 担当者 1 名 · 2025年3月3日 に作成

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• Writing Interchange to GROMACS requires 1-indexed atom residues, writing to OpenMM does not

  再び着手できるかも @j-wags が 599 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  gromacs

  openforcefield/openff-interchange#1177 · コメント 2 件 · 担当者 1 名 · 2025年2月28日 に作成

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• Add examples of loading GROMACS topologies mixed with data from `$GMXDATA`

  オープン

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  gromacs

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 35/100

  openforcefield/openff-interchange#1151 · コメント 1 件 · 2025年1月23日 に作成

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• Support vacuum simulations in LAMMPS export

  オープン

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  lammps

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

  openforcefield/openff-interchange#1145 · 2025年1月16日 に作成

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• Push parameter caching up to `Collection`?

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  openforcefield/openff-interchange#1143 · 2025年1月15日 に作成

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• Consider making `ElectrostaticsCollection.invalidate_cache`

  オープン

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 47/100

  openforcefield/openff-interchange#1142 · 2025年1月15日 に作成

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• LAMMPS writer can't export TIP3P water with constraints

  再び着手できるかも @mattwthompson が 654 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  bug feedback needed lammps needs-info

  openforcefield/openff-interchange#1141 · コメント 18 件 · 担当者 2 名 · 2025年1月15日 に作成

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• Position restraints in GROMACS files

  オープン

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  gromacs

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 30/100

  openforcefield/openff-interchange#1135 · 2025年1月10日 に作成

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• Consider allowing importing OpenMM objects with different numbers of particles

  オープン

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  openmm

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  openforcefield/openff-interchange#1124 · 2024年12月11日 に作成

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• Interchange export loses atom naming

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  needs-info

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

  openforcefield/openff-interchange#1114 · コメント 1 件 · 2024年11月21日 に作成

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• add from_mbuild function

  オープン

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  needs-info

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  openforcefield/openff-interchange#1109 · コメント 1 件 · 2024年11月15日 に作成

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• Non-orthorhombic simulation boxes with LAMMPS

  再び着手できるかも @timbernat が 724 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  lammps

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

  openforcefield/openff-interchange#1091 · コメント 4 件 · 2024年11月2日 に作成

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• Ensure charge increments of virtual sites' orientation atoms are logged

  オープン

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  documentation

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

  openforcefield/openff-interchange#1088 · 2024年11月1日 に作成

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• LAMMPS reports slightly different torsion energies

  オープン

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  help wanted lammps

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

  openforcefield/openff-interchange#1086 · コメント 7 件 · 2024年10月29日 に作成

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• Expose molecule-virtual site map

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  enhancement

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 15/100

  openforcefield/openff-interchange#1076 · コメント 1 件 · 2024年10月9日 に作成

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• Document how users can modify charges after creation

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  documentation

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

  openforcefield/openff-interchange#1071 · 2024年10月3日 に作成

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