リポジトリ

olgabot のリポジトリ

214 件の対応リポジトリ

索引済み issue があるリポジトリを表示
olgabot/10xdashC++

Pairwise similarity metrics for 10x barcoded RNASeq datasets

最終コミット 2023年12月11日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/2020-test-senchaJupyter Notebook

最終コミット 2020年5月31日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/2020-workflows-paperHTML

Strategies for leveraging workflow systems to streamline large-scale biological analyses

最終コミット 2020年6月2日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/2021-01-27-olga-remove-proteinStandard ML

最終コミット 2021年1月28日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/2021-paper-metapangenomesHTML

最終コミット 2022年6月5日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/2022-ced9-bcl2Standard ML

Structural homology between C. elegans Ced9 and human BCL2

最終コミット 2024年11月6日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/2022-mouse-lemur-tabula-microcebus

Code for cross-species and uTAR sequence homology analyses for two Tabula Microcebus papers

最終コミット 2022年9月9日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/2022-sourmash-multigather-kmer-stats

Do sourmash multigather, but use a background k-mer distribution model to quantify significance of matches, and report all matching k-mer sequences

最終コミット 2022年12月1日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/2022-sourmash-multisearchJupyter Notebook

Search multiple query k-mer signatures against a database

最終コミット 2023年2月18日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/2023-functional-homology-paperHTML

最終コミット 2024年3月15日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/Deedy-ResumeTeX

A one page , two asymmetric column resume template in XeTeX that caters to an undergraduate Computer Science student

最終コミット 2015年12月2日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/FRC_alignC++

Computes FRC from SAM/BAM file and not from afg files

最終コミット 2018年8月7日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/GPfatesPython

最終コミット 2017年2月20日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/GSEApyPython

Gene Set Enrichment Analysis in Python

最終コミット 2017年7月9日

 (0 stars) (1 fork) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/Keras-genomicsPython

Perform hyper-parameter tuning, training, testing and prediction with Keras

最終コミット 2018年3月29日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/MISOC

MISO: Mixture of Isoforms model for RNA-Seq isoform quantitation

最終コミット 2013年7月13日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/MultiQCPython

Aggregate results from bioinformatics analyses across many samples into a single report.

最終コミット 2018年7月13日

 (1 star) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/NouGATPython

最終コミット 2017年4月5日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/OrthoFinderPython

Phylogenetic orthology inference for comparative genomics

最終コミット 2021年10月8日

 (1 star) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
olgabot/OrthologyOntology

Working draft of a common ontology for describing orthology resources

最終コミット 2019年10月21日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)