nf-core/deepvariant

Deepvariant Version

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#19 opened on 2019/02/17

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説明

@ewels Hello,

  1. Could you update the pipeline to 0.72 version?

  2. If i run it locally on my pc, will it use my acceleration cores of my GPU?

コントリビューターガイド

調査方針
DeepVariantバージョンがNextflowパイプラインで定義されている場所を調べ、その更新方法を確認してください。GPU使用に関する質問については、DeepVariantコンテナとパイプライン設定のGPU対応状況を確認してください。
技術スタック
pythontensorflowdocker
領域
datamachine learning
Issue 種別
機能
難度新しい貢献者にとっての実装難度です。1 は非常に小さな変更、5 は専門的な作業です。
2
推定時間経験ある貢献者が調査、実装、テスト、pull request 準備にかけるおおよその時間範囲です。
1-3時間
活動状況Issue が今どれだけ取り組みやすいかを示します。新しい、活発、古い、ブロック中、またはメンテナー入力待ちなどです。
アクティブ
明確さ期待される変更、受け入れ条件、次の手順がどれだけ明確かを示します。
おおむね明確
前提条件
GitNextflowDocker
初心者向け度初回貢献者にどれだけ取り組みやすいかを 1-100 で推定したスコアです。
75