Adding driver for Tiff images
まだ誰も着手していません。
評価
調査の方向性
PNG driver の例を読み、Zarr driver と比較する。driver と file-kvstore の設定から、path を含めて TensorStore::Open を追跡する。issue ではテストも完了の境界も定義されていないため、初期目標が libtiff による読み取りなのか、chunked OME-TIFF I/O なのかを maintainer に確認する。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Hello there.
I am trying to see if I can add support for reading (and eventually writing) Tiff images using tensorstore. The motivation is to be able to read/write large OMETiff images. Initially I am following the png driver example to create an interface with libtiff library. But, longer term, I would prefer to do the IO in a chunked fashion. Since Tiff has the concept of tiles (X and Y axis) and IFDs (Z axis and additional dimensions, at least according to OME spec), I think chucked IO will work similar to zarr driver.
I am looking for some guidance for getting started. For example, if I have something like the following, how does information of which file need to be opened gets to the driver?
tensorstore::Context context = Context::Default();
TENSORSTORE_CHECK_OK_AND_ASSIGN(auto store, tensorstore::Open({{"driver", "tiff"},
{"kvstore", {{"driver", "file"},
{"path", "p01_x01_y01_wx0_wy0_c1.ome.tif"}}
}},
context,
tensorstore::OpenMode::open,
tensorstore::RecheckCached{false},
tensorstore::ReadWriteMode::read).result());
- 主要言語
- C++
- スター
- 1.6k
- フォーク
- 151
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
環境構築
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートなし
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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