[Bug] Prediction API 500 Error on Molecules Containing Adamantane Substructure
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評価
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 初心者へのやさしさ
- 42/100
- issue の種類
- バグ
- 明瞭さ
- 説明が足りない
- 活発さ
- 静か
- 技術スタック
- typescript
調査の方向性
報告された SMILES または SDF を prediction API 経由で使用して 500 レスポンスを再現し、返された「Cannot read properties of undefined」エラーから失敗しているリクエストパスを追跡します。adamantane を含む分子が 500 エラーではなく正常に予測を返すようになれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
When attempting to predict NMR spectrum for molecules containing an adamantane cage/substructure (adamantane derivatives), the server consistently returns a 500 Internal Server Error.
The same structures can be successfully predicted in MestReNova, confirming the molecular structures are valid.
Error Message:
{
"statusCode": 500,
"error": "Internal Server Error",
"message": "Cannot read properties of undefined (reading 'length')"
}
Molecular information:
SMILES: O=C([O-])C1=C(F)C(F)=C(OC(=O)C23CC4CC(CC(OC(=O)C5=CC(I)=CC(I)=C5I)(C4)C2)C3)C(F)=C1F
SDF:
Untitled Document-1
ChemDraw04012613512D
38 42 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000
3.4766 -2.9566 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.8891 -2.2421 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.7141 -2.2421 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.4766 -1.5276 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.6516 -1.5276 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.2391 -2.2421 0.0000 F 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.2391 -0.8132 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.4141 -0.8132 0.0000 F 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.6516 -0.0987 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.2391 0.6158 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.4141 0.6158 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.0016 -0.0987 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.0016 1.3302 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.6905 1.7456 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.6853 2.5500 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.9913 2.9566 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.2872 2.5677 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.4273 2.1552 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.4273 1.3302 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.1418 0.9177 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.8563 1.3302 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.8563 2.1552 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-2.5707 0.9177 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.2852 1.3302 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.9997 0.9177 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-4.7141 1.3302 0.0000 I 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.9997 0.0927 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.2852 -0.3198 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.2852 -1.1448 0.0000 I 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-2.5707 0.0927 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.8563 -0.3198 0.0000 I 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.4300 2.2848 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.2872 0.9177 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.0016 2.1552 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.4766 -0.0987 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.8891 0.6158 0.0000 F 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.8891 -0.8132 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.7141 -0.8132 0.0000 F 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1 2 2 0
2 3 1 0
2 4 1 0
4 5 2 0
5 6 1 0
5 7 1 0
7 8 1 0
7 9 2 0
9 10 1 0
10 11 1 0
11 12 2 0
11 13 1 0
13 14 1 0
14 15 1 0
15 16 1 0
16 17 1 0
17 18 1 0
18 19 1 0
19 20 1 0
20 21 1 0
21 22 2 0
21 23 1 0
23 24 2 0
24 25 1 0
25 26 1 0
25 27 2 0
27 28 1 0
28 29 1 0
28 30 2 0
23 30 1 0
30 31 1 0
19 32 1 0
15 32 1 0
19 33 1 0
13 33 1 0
17 34 1 0
13 34 1 0
9 35 1 0
35 36 1 0
35 37 2 0
4 37 1 0
37 38 1 0
M CHG 1 3 -1
M END
$$$$
- 主要言語
- TypeScript
- スター
- 84
- フォーク
- 35
- 平均マージ
- 3日 7時間
- マージ済み PR（30日）
- 8
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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