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Validate ABFE benchmarks on host-guest systems

オープン
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評価

難易度
4/5
見積もり時間
3〜5日
初心者へのやさしさ
45/100
issue の種類
機能追加
明瞭さ
おおむね明確
活発さ
静か
技術スタック
python
領域
testing-qa

調査の方向性

まず、正味電荷を持つリガンドを含む SAMPL の host-guest ベンチマークセットを特定し、既存の ABFE ベンチマークのエントリーポイントと検証データを見つけます。現在の host-guest ベンチマークを実行し、関連する荷電系に対象範囲を拡張して、得られたベンチマーク出力によって正味電荷のサポートが検証されていることを確認します。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

説明

Several of the SAMPL sets have ligands with net charges. We should benchmark our net charge support on them.

主要言語
Python
スター
343
フォーク
59
平均マージ
2日 9時間
マージ済み PR(30日)
43

環境構築

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

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