Recipes: create a workflow's linked boxes from a recipe, with the level of theory chosen in a dialog
@ohlincha がすでに取り組んでいます。
2026年11月1日 から。
評価
調査の方向性
Read the workflow designs in #341 and #674 and inspect docs/design/recipes/recipe-flow-v2.png first. The issue proposes recipe files, rule-based recommendations, workflow creation and links, and several future recipe features, but does not identify implementation files or tests. Agree on the proposed scope before starting; done means the agreed recipe flow works and its workflow boxes and links remain editable.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Design agreed so far (maintainer, 2026-10-30). Builds on workflows (#341, #674).
Flow. Open a workflow (or select a box in one) → Apply Recipe → choose a recipe → the recipe creates the job boxes, already linked. Mock-up of the flow (docs/design/recipes/recipe-flow-v2.png):
Decisions
- A recipe applies to a new workflow and from a selected box (the chain is appended after it).
- Structures are not asked for in the dialog: the boxes are placeholders, and the user clicks a box marked "needs structure" to build or import it. All other settings come from the dialog; each box stays editable like any calculation.
- The level of theory is chosen per role (e.g. "geometry and frequencies", "final energies", solvent), with a recommendation and the reason shown next to it.
- Recommendations come from rules, not a fixed table: the recipe's defaults in the dialog, and the rules applied again when a structure is set in a box (anion → diffuse functions; elements beyond Kr → an ECP; size → RI or a smaller basis; codes registered on the chosen machine), as warnings in that box. Never blocking.
Proposed, to settle
- Recipe file: a templated workflow.txt (steps with code, run type and ES.* settings; links for geometry, orbitals, Hessian, join roles and scan point) plus a description and the rules, so that a site (central server) can supply its own recipes with fixed levels of theory for a class.
- Code variants per recipe (e.g. G16 QST3 or ORCA NEB-TS), unregistered codes greyed out.
- Built-in recipes per field: TS search with IRC; conformers (CREST → xTB → DFT, #682); gas → solvent with the Hessian carried over; redox potential; pKa.
- Save Workflow as Recipe (settings and links kept, structures and results dropped).
- An optional final analysis box (ΔG with its low-frequency spread #692, rate constants #330).
- Later: fan-out (one box per conformer pattern, #708).
- 主要言語
- C
- スター
- 10
- フォーク
- 8
- 平均マージ
- 21分
- マージ済み PR（30日）
- 1
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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