EPPIcenter

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• Unit-test CI as a JOSS gate

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  wayfinder:grilling

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

  EPPIcenter/sampledb3#86 · 2026年8月27日 に作成

• JOSS paper outline

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  wayfinder:prototype

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 68/100

  EPPIcenter/sampledb3#85 · 2026年8月27日 に作成

• Public GitHub and docs presence

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  wayfinder:prototype

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 68/100

  EPPIcenter/sampledb3#84 · 2026年8月27日 に作成

• Software design argument

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  wayfinder:grilling

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  EPPIcenter/sampledb3#83 · 2026年8月27日 に作成

• State of the field for the paper

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  wayfinder:grilling

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 45/100

  EPPIcenter/sampledb3#82 · 2026年8月27日 に作成

• JOSS author list

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  wayfinder:grilling

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

  EPPIcenter/sampledb3#81 · 2026年8月27日 に作成

• Research impact we can claim

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

  EPPIcenter/sampledb3#80 · 2026年8月27日 に作成

• Specimen-inventory comparators

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  wayfinder:research

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 62/100

  EPPIcenter/sampledb3#79 · 2026年8月27日 に作成

• Way to a JOSS-submittable SampleDB

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  wayfinder:map

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 30/100

  EPPIcenter/sampledb3#76 · コメント 1 件 · 2026年8月27日 に作成

• Documentation and release notes for count observation model

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 58/100

  EPPIcenter/moire#50 · 2026年6月18日 に作成

• Count-aware simulator and simulation smoke test

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100

  EPPIcenter/moire#49 · 2026年6月18日 に作成

• Count Poisson observation model — full MCMC inference path

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 38/100

  EPPIcenter/moire#48 · 2026年6月18日 に作成

• Count data loading and genotyping initialization

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100

  EPPIcenter/moire#47 · 2026年6月18日 に作成

• Observation model interface with binary parity

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 68/100

  EPPIcenter/moire#46 · 2026年6月18日 に作成

• PRD: Count-based observation model (alternative to binary error process)

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

  EPPIcenter/moire#45 · 2026年6月18日 に作成

• Whole Genome Data

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  EPPIcenter/dcifer#3 · コメント 2 件 · 2025年5月23日 に作成

• Memory issue with very long allele names

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

  EPPIcenter/moire#44 · 2025年3月26日 に作成

• Select samples for allele frequency estimation

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  EPPIcenter/moire#43 · コメント 1 件 · 2025年3月6日 に作成

• Inverse function to matchAfreq

  オープン

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

  EPPIcenter/dcifer#2 · コメント 5 件 · 2024年11月22日 に作成

• take a closer look at adaptation algorithms

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 10/100

  EPPIcenter/moire#41 · 2024年11月8日 に作成

• Detect potential data issues

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  EPPIcenter/moire#30 · 2024年9月6日 に作成

• add diagnostics for parallel tempering

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  EPPIcenter/moire#29 · 2024年9月6日 に作成

• allow for ZINB distributed COI

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 30/100

  EPPIcenter/moire#22 · 2024年6月30日 に作成

• add support for multiple populations

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  EPPIcenter/moire#21 · 2024年6月30日 に作成

• Convenience functions

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  EPPIcenter/moire#7 · 2023年10月2日 に作成

• Estimation of relatedness in parasites from a single infection using single cell RNA seq data

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  EPPIcenter/dcifer#1 · コメント 1 件 · 2023年2月9日 に作成

• eliminate openmp dependency and use tbb

  対応中かも @m-murphy が 841 日前に担当しました。 オープン

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  enhancement

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  EPPIcenter/moire#17 · 2024年6月28日 に作成