Select molecular states and record preparation decisions for docking
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Valutazione
- Difficoltà
- 5/5
- Tempo stimato
- Più di una settimana
- Idoneità per principianti
- 35/100
- Tipo di issue
- Funzionalità
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Stato di attività
- Attiva
- Stack tecnologico
- python
- Ambito
- bioinformatics
Direzione di ricerca
Start with devguide/pending_proposals/select_molecular_states_and_record_preparation_decisions_for_docking.md, then review the related MolSysMT issues #217, #218, #220, #221, and #222. Determine how docking results can be associated with ligand and receptor states, pH, variants, retained waters or cofactors, and transformation parameters. Done means these preparation decisions and source inputs are explicit and traceable in a docking run.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
What — Make the chosen ligand and receptor states and preparation decisions explicit in a docking run.
How — Record ligand chemical state and conformer, receptor state, pH and residue variants, retained waters/cofactors, and any transformation parameters; associate each result with those inputs.
Why — The Core MVP requires prepared states and backend representations to be traceable to source systems.
Record — devguide/pending_proposals/select_molecular_states_and_record_preparation_decisions_for_docking.md
Related — uibcdf/dockingmt#3. DockingMT consumes MolSysMT state selection and preparation capabilities tracked in uibcdf/molsysmt#217, uibcdf/molsysmt#218, uibcdf/molsysmt#220, uibcdf/molsysmt#221, and uibcdf/molsysmt#222.
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 1
- Fork
- 0
- Merge medio
- 30m
- PR unite (30g)
- 1
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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