Track planned MolSysMT PDBQT and SDF form support
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Valutazione
- Difficoltà
- 5/5
- Tempo stimato
- Più di una settimana
- Idoneità per principianti
- 25/100
Direzione di ricerca
Track MolSysMT issues #214 (PDBQT) and #215 (SDF) first; they own the format contracts and are planned for post-1.0. Once those conversions are available and tested, revisit DockingMT's ligand and receptor input path and Vina integration; done means the supported forms work through the docking workflow.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
What — Track MolSysMT's planned PDBQT file/string and SDF file forms for DockingMT's Vina workflows.
How — The provider proposals are uibcdf/molsysmt#214 (PDBQT) and uibcdf/molsysmt#215 (SDF). DockingMT should revisit its ligand and receptor input path when those form conversions are available and tested.
Why — Vina consumes PDBQT for docking, while SDF is a common ligand exchange format. Keeping the form adapters in MolSysMT gives DockingMT a shared molecular-system representation and a visible upstream dependency.
This issue is a coordination pointer. The linked MolSysMT issues own the format contracts; docking-specific preparation and Vina integration remain DockingMT concerns. Both provider proposals are planned for post-1.0, not implemented.
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 1
- Fork
- 0
- Merge medio
- 30m
- PR unite (30g)
- 1
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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