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Port C++ psis code to loo?

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
cpp, r
Ambito
performance

Direzione di ricerca

Inizia misurando quanto tempo richiede attualmente il campionamento PSIS nel loo R package, quindi esamina l’implementazione di Stan in src/stan/services/pathfinder/psis.hpp. Confronta il potenziale aumento di velocità con il costo dell’aggiunta di una dipendenza da Rcpp e Stan; il lavoro è completato quando è stato stabilito se il porting vale la pena ed è stato definito un approccio di implementazione.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

In Stan we have a lot of the code for psis sampling available as C++.

https://github.com/stan-dev/stan/blob/develop/src/stan/services/pathfinder/psis.hpp

It should be a good bit faster. How much time do you ballpark the psis sampling takes / would it be a lot better if it was faster in R?

We could do this by writing some Rcpp to call the functions in Stan. However this would be a large dependency to add so if the current speed is fine then idt we should worry about this too much.

But if speed is an issue happy to put this on my plate to do at some point

Lingua principale
R
Stelle
157
Fork
38
Merge medio
4g 16h
PR unite (30g)
2

Guida per i contributori

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Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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