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summary for standalone GQ, VI, etc.

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python
Ambito
data, developer-experience

Direzione di ricerca

Inizia ispezionando il metodo CmdStanMCMC.summary() esistente e l’helper di riepilogo di alto livello, quindi confronta gli output esposti da CmdStanMCMC, CmdStanGQ e CmdStanVB. Determina come vengono estratti i campioni e se l’approssimazione di Laplace è supportata; il lavoro è completato quando i risultati di campionamento supportati seguono un percorso di riepilogo coerente e il comportamento di Laplace è stato risolto esplicitamente.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

feature
Summary

Any object returned by sampling should allow .summary() to be called on it to report mean, sd, MCMC SE, quantiles, and R-hat. This includes objects returned by

  • CmdStanMCMC: MCMC sampling
  • CmndStanGQ: generated quantities
  • CmdStanVB: variational inference
  • ???: Laplace approximation

Is Laplace approximation not supported yet in CmdStanPy? It will also return a sample of multiple draws and should also include a .summary() method.

Description

One way to do this would be to have each of these wrapper objects allow the actual draws to be extracted. Right now, there is a high-level "helper" function, where if mcmc_fit is a CmdStanMCMC object, I just call mcmc_fit.summary() directly. I would rather have this work by mcmc_fit.draws() pulling out a simple draws object on which the summary() operates. Then the other object would also support a .draws() extraction and then summary() would be a standalone function that applies to a draws object rather than to the whole output of a run (I don't know what else is in the CmdStanMCMC object---I only ever use the draws).

Current Version

1.1.0

Lingua principale
Python
Stelle
198
Fork
81
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

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Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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