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dynamic traceplot for jupyter notebooks

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
jupyter-notebook, python

Direzione di ricerca

Inizia esaminando come la barra di avanzamento tqdm monitora l'output standard e come i file di output CSV di Stan espongono lp__ tra le catene. Definisci il comportamento rivolto al notebook per una traccia dinamica di lp__ durante warmup e sampling; il lavoro è completato quando la visualizzazione si aggiorna tra le catene senza monitorare i singoli parametri.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

feature
Summary:

It would be super cool to provide a dynamic traceplot of the value of lp__ (total joint log probability for the model) across all chains during warmup and sampling - is this possible?

Description:

showed Andrew Gelman Colab jupyter notebooks (R version) and he asked for this dynamic visualization. we could pull this off the output files similar to the way that the tqdm progress bar monitors standard out. given the current Stan csv format, the first column is the lp__ - the total joint log probability. generally, when lp__ converges, all params have converged, conversely, if any params have not converged, lp__ will not converge either, so this would be good enough

we want to discourage folks from trying to monitor a particular param - there are other more appropriate tools that should be used - so simple feature - just monitor lp__ across chains!

Additional Information:
Current Version:
Lingua principale
Python
Stelle
198
Fork
80
Merge medio
6g 5h
PR unite (30g)
1

Preparare l'ambiente

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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