standalone generated quantities need way to run stansummary on resulting csv file

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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
45/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
cpp
Ambito
cli

Direzione di ricerca

Inizia con l’output di CmdStan generate_quantities e la gestione da parte di stansummary descritti nell’issue, quindi esamina come stan::io::csv_reader analizza i commenti e le colonne CSV. Aggiungi i commenti thin e timing mancanti e consenti l’assenza delle colonne dei parametri del sampler; il lavoro è completo quando il CSV risultante può essere analizzato e riepilogato da stansummary.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

enhancement user experience
Summary:

The CmdStan method generate_quantities doesn't directly provide a way to summarize the output csv file;
either modify stansummary to recognize generate quantities output, or create new utility.

Description:

The csv output file isn't a proper Stan csv output file - it's missing:

  • initial comment with "thin" information
  • final comments for timing information

Add comments to CSV file so that it looks like a Stan CSV file that can be parsed
by stan::io::csv_reader; modify stansummary so that missing sampler params columns are OK.

Current Version:

v2.23.0

Lingua principale
C++
Stelle
240
Fork
105
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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