nf-core/sarek

Tutorial: CNV calling

Aperta

#1713 aperta il 30 ott 2024

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Descrizione

Topic

CNVs analysis using Sarek

Tasks to realise the tutorial

  1. identify appropriate software
  2. simulate CNV data (max size 100Mb each)
  3. prepare gitpod / codespaces environment and build code
  4. prepare theoretical intro
  5. write down hands-on tutorial

Guida contributor

Direzione di ricerca
Segui l'elenco delle attività: identifica il software appropriato per il rilevamento delle CNV, simula i dati CNV (max 100MB ciascuno), prepara l'ambiente Gitpod/Codespaces e costruisci il codice, prepara un'introduzione teorica e scrivi un tutorial pratico.
Tech stack
Nessuno
Dominio
data
Tipo issue
Documentazione
DifficoltàQuanto dovrebbe essere impegnativa per un nuovo contributor.
1
Tempo stimatoTempo stimato per completare e verificare uno scope piccolo.
Mezza giornata
Stato attivitàQuanto è probabile che la issue sia ancora attiva e reviewable.
Nuova
ChiarezzaQuanto chiaramente la issue descrive problema, scope e risultato atteso.
Chiara
Prerequisiti
Git
Adatta ai principiantiQuanto la issue è adatta a contributor alla prima esperienza.
90