nf-core/sarek

Proposals for Sarek Tutorials on use-cases

Aperta

#1704 aperta il 28 ott 2024

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Metriche repository

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Descrizione

@edmundmiller and friends :) this is a placeholder to collect ideas to realise additional tutorials on use-cases of sarek Variant Calling is currently being integrated (http://lescai-teaching.github.io/sarek-tutorial/) into sarek repo usage docs. Similar things could be realised for:

  • CNV calling
  • UMI somatic variant calling [ propose others here]

Guida contributor

Direzione di ricerca
Identificare i casi d'uso comuni per sarek oltre al variant calling standard, come il CNV calling e il UMI somatic variant calling, e proporre argomenti per tutorial.
Tech stack
Nessuno
Dominio
documentation
Tipo issue
Documentazione
DifficoltàQuanto dovrebbe essere impegnativa per un nuovo contributor.
2
Tempo stimatoTempo stimato per completare e verificare uno scope piccolo.
Meno di 1 ora
Stato attivitàQuanto è probabile che la issue sia ancora attiva e reviewable.
Attiva
ChiarezzaQuanto chiaramente la issue descrive problema, scope e risultato atteso.
Chiara
Prerequisiti
Nessuno
Adatta ai principiantiQuanto la issue è adatta a contributor alla prima esperienza.
75