nf-core/deepvariant

Deepvariant Version

Aperta

#19 aperta il 17 feb 2019

Vedi su GitHubGuida contributor
 (17 commenti) (0 reazioni) (0 assegnatari)Nextflow (26 fork)auto 404
feature-requestgood first issue

Metriche repository

Star
 (41 stelle)
Metriche merge PR
 (Metriche PR in attesa)

Descrizione

@ewels Hello,

  1. Could you update the pipeline to 0.72 version?

  2. If i run it locally on my pc, will it use my acceleration cores of my GPU?

Guida contributor

Direzione di ricerca
Investiga dove è definita la versione di DeepVariant nel pipeline Nextflow e come aggiornarla. Considera la domanda sull'uso della GPU controllando il container di DeepVariant e la configurazione del pipeline per il supporto GPU.
Tech stack
pythontensorflowdocker
Dominio
datamachine learning
Tipo issue
Funzionalità
DifficoltàQuanto dovrebbe essere impegnativa per un nuovo contributor.
2
Tempo stimatoTempo stimato per completare e verificare uno scope piccolo.
1-3 ore
Stato attivitàQuanto è probabile che la issue sia ancora attiva e reviewable.
Attiva
ChiarezzaQuanto chiaramente la issue descrive problema, scope e risultato atteso.
Abbastanza chiara
Prerequisiti
GitNextflowDocker
Adatta ai principiantiQuanto la issue è adatta a contributor alla prima esperienza.
75