neurostuff/autonima

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• Built-in full-text retrieval from publisher text-mining APIs (Elsevier, Springer Nature)

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  neurostuff/autonima#83 · Aperta il 28/9/2026

• Criteria IDs are numbered across both screening stages, so adding an abstract criterion relabels cached full-text decisions

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  neurostuff/autonima#81 · Aperta il 28/9/2026

• Config fields that validate but do nothing, and a full_text_sources validation rule that never runs

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  Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 68/100

  neurostuff/autonima#80 · Aperta il 28/9/2026

• this branch of pubget should be used in order to keep access to demographic tables/other important information in the extracted text.

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  Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

  neurostuff/autonima#74 · Aperta il 16/9/2026

• ASRreview inspiration

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  Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

  neurostuff/autonima#71 · Aperta il 8/9/2026

• Abstract screening: output is 88% of the stage's cost, and it is all written justification

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  neurostuff/autonima#69 · Aperta il 4/9/2026

• Prompts put varying content before invariant content, so prefix caching almost never hits (1.7% on full-text screening)

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  neurostuff/autonima#68 · Aperta il 4/9/2026

• Screening and annotation send the bibliography to the model: ~35% of input is never used

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  neurostuff/autonima#67 · Aperta il 4/9/2026

• One failing full_text_source silently discards all the others (99% corpus loss from a missing optional dependency)

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  neurostuff/autonima#66 · Aperta il 3/9/2026

• Unresolvable table_id aborts the whole run instead of degrading one analysis's metadata

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  neurostuff/autonima#65 · Aperta il 3/9/2026

• No record of what changed between config versions: derive a semantic version diff in the UI

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  neurostuff/autonima#64 · Aperta il 3/9/2026

• synthscholar

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  neurostuff/autonima#63 · Aperta il 2/9/2026

• Sparse analysis names: 2.6% of analyses are unnamed AND 74% of those have no description, so annotation has nothing to judge from

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  Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 52/100

  neurostuff/autonima#61 · Aperta il 30/8/2026

• Duplicate coordinate tables reach the meta-analysis: ~30% of papers carry re-ingested tables, silently double-weighting studies

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  neurostuff/autonima#60 · Aperta il 30/8/2026

• annotation metadata_fields has two different defaults depending on construction path (study_fulltext included or not)

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  neurostuff/autonima#59 · Aperta il 27/8/2026

• Unknown config keys are silently dropped in annotation/screening/retrieval and at top level (but rejected in search/output)

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  neurostuff/autonima#58 · Aperta il 27/8/2026

• search: query and pmids_file are silently unioned, but the docstring says query is ignored

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  neurostuff/autonima#57 · 1 commento · Aperta il 27/8/2026

• PubMed abstracts truncated to first section; titles cut at inline markup; MeSH never collected

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  neurostuff/autonima#56 · Aperta il 26/8/2026

• Add a machine-readable provenance field to configs (what changed, who changed it, informed by what)

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  neurostuff/autonima#55 · Aperta il 26/8/2026

• No token/cost accounting: per-stage API cost cannot be reconstructed from run outputs

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  neurostuff/autonima#54 · Aperta il 26/8/2026

• PubMed search silently truncates at 10,000 results; max_results above that is ignored

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  neurostuff/autonima#53 · Aperta il 26/8/2026

• Idea: Enable local models

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  neurostuff/autonima#52 · Aperta il 25/8/2026

• UI Ideas

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  neurostuff/autonima#48 · Aperta il 20/5/2026

• IDEA: Auto-extract concepts, definitions, tasks for discovery

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  neurostuff/autonima#46 · Aperta il 7/5/2026

• Compare neurostore-text-extractor with autonima

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  neurostuff/autonima#45 · Aperta il 27/4/2026

• Prevent stripping of figures and tables during full text screening

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  neurostuff/autonima#44 · 1 commento · Aperta il 16/4/2026

• IDEA: Stricter screening * "unsure" categorization

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  neurostuff/autonima#40 · Aperta il 17/2/2026

• Determine why apples-to-apples annotation in social meta-analysis is still not great

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  evaluation

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  neurostuff/autonima#39 · Aperta il 16/2/2026

• Add grounding of inclusion/exclusion reasons

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  neurostuff/autonima#38 · Aperta il 29/1/2026

• Add reporting and researcher-in-the-loop evaluation tools

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  neurostuff/autonima#37 · 1 commento · Aperta il 29/1/2026

• Add supplemental PDFs as extraction input

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  neurostuff/autonima#36 · Aperta il 29/1/2026

• Implement Flex Pricing

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  neurostuff/autonima#35 · Aperta il 29/1/2026

• Ingest analyses from ACE & ns-pond

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  neurostuff/autonima#27 · Aperta il 30/9/2025

• bug: Search cache adds results that are not in new result

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  neurostuff/autonima#16 · Aperta il 5/9/2025

• Generate PRISMA Chart

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  neurostuff/autonima#11 · Aperta il 4/9/2025