Question regarding N1-methylpseudouridine detection support
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Valutazione
- Difficoltà
- 5/5
- Tempo stimato
- Più di una settimana
- Idoneità per principianti
- 25/100
- Tipo di issue
- Funzionalità
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Attiva
- Stack tecnologico
- rust
- Ambito
- bioinformatics
Direzione di ricerca
No files, tests, or entry points are mentioned in the issue. Start by reviewing modkit’s documented modified-base support and the PromethION/RNA 004 context; done means confirming whether N1-methylpseudouridine detection and analysis are supported, and if not, identifying the relevant limitation or requested feature.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Hello,
I am currently exploring various tools to analyze N1-methylpseudouridine modifications using direct RNA-seq data.
I was wondering if it is possible to detect and analyze N1-methylpseudouridine modifications using this tool? For context, my data is generated using the PromethION platform with the RNA 004 kit.
Thank you in advance for your help!
- Lingua principale
- Rust
- Stelle
- 274
- Fork
- 33
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
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