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DIsable to predict properties by fairseq-generate

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python, pytorch
Ambito
machine-learning

Direzione di ricerca

Riproduci innanzitutto il comando fairseq-generate e il traceback segnalati. Segui la configurazione attraverso fairseq_cli/generate.py, fairseq/tasks/graph_prediction.py e fairseq/data/pyg_datasets/pyg_dataset_lookup_table.py, concentrandoti sul motivo per cui pcqm4m viene rifiutato. Il lavoro è completato quando il comando di prediction documentato non genera più questo errore relativo al nome del dataset e la property prediction può procedere.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

After training on pcqm4mv2, I wanted to use checkpoint to predict properties. So I used
fairseq-generate $data_binarization --task graph_prediction --path ckpts/checkpoint_best.pt --num-classes 1
The bug was shown as:
Using backend: pytorch Traceback (most recent call last): File "/home/nv3090x2/下载/ENTER/envs/graphormer/bin/fairseq-generate", line 8, in <module> sys.exit(cli_main()) File "/home/nv3090x2/下载/ENTER/lib/python3.9/site-packages/fairseq_cli/generate.py", line 413, in cli_main main(args) File "/home/nv3090x2/下载/ENTER/lib/python3.9/site-packages/fairseq_cli/generate.py", line 50, in main return _main(cfg, sys.stdout) File "/home/nv3090x2/下载/ENTER/lib/python3.9/site-packages/fairseq_cli/generate.py", line 83, in _main task = tasks.setup_task(cfg.task) File "/home/nv3090x2/下载/ENTER/lib/python3.9/site-packages/fairseq/tasks/__init__.py", line 46, in setup_task return task.setup_task(cfg, **kwargs) File "/home/nv3090x2/下载/ENTER/lib/python3.9/site-packages/fairseq/tasks/graph_prediction.py", line 179, in setup_task return cls(cfg) File "/home/nv3090x2/下载/ENTER/lib/python3.9/site-packages/fairseq/tasks/graph_prediction.py", line 155, in __init__ self.dm = GraphormerDataset( File "/home/nv3090x2/下载/ENTER/lib/python3.9/site-packages/fairseq/data/dataset.py", line 84, in __init__ self.dataset = PYGDatasetLookupTable.GetPYGDataset(dataset_spec, seed=seed) File "/home/nv3090x2/下载/ENTER/lib/python3.9/site-packages/fairseq/data/pyg_datasets/pyg_dataset_lookup_table.py", line 102, in GetPYGDataset raise ValueError(f"Unknown dataset name {name} for pyg source.") ValueError: Unknown dataset name pcqm4m for pyg source.
I really hope you can help me with the bug. Thank you very much.

Lingua principale
Python
Stelle
2.5k
Fork
374
Merge medio
14h 51m
PR unite (30g)
3

Preparare l'ambiente

Non abbiamo ancora controllato i file di configurazione di questo progetto. Parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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