How to quantify evidence of co-functionality?
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Valutazione
- Difficoltà
- 5/5
- Tempo stimato
- Più di una settimana
- Idoneità per principianti
- 25/100
- Tipo di issue
- Funzionalità
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Ferma
- Stack tecnologico
- r
- Ambito
- bioinformatics
Direzione di ricerca
Non vengono indicati file, test o punti di ingresso. Inizia definendo le due metriche separate di co-funzionalità proposte nell’issue e determinando come dovrebbero integrarsi nei calcoli esistenti di similarità funzionale di BioCor. Il lavoro è completo quando le definizioni delle metriche e l’ambito dell’implementazione sono stati concordati.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
From Bioinformatics:
"quantify how likely two genes are correlated in their enrichment, function etc. For example, using STRING we can see that PIK3CA and PTEN are more co-functioning than PIK3CA and SF3B1. "
The question is how to add this higher co-functioning evidence in BioCor? My answer is that this should be two separate metrics.
- Lingua principale
- R
- Stelle
- 14
- Fork
- 1
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
- Nessun Dockerfile né file Docker Compose
- Nessun modello di pull request
- Leggi la guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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