Proprietario

lgatto

6 repository indicizzati · Vedi su GitHub

MSnbase
Base Classes and Functions for Mass Spectrometry and Proteomics

R · 137 stelle
pRoloc
A unifying bioinformatics framework for organelle proteomics

R · 16 stelle
pRolocGUI
Interactive visualisation and exploration of spatial proteomics data

R · 8 stelle
rpx
R Interface to the ProteomeXchange Repository

R · 7 stelle
pRolocdata
Data accompanying the pRoloc package

R · 6 stelle
mulink-qfeatures

R · 1 stella

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

Differences before and after write/read Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 55/100

lgatto/mulink-qfeatures#6 · Aperta il 4/9/2026
brunner2022: some dimnames are changed Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 68/100

lgatto/mulink-qfeatures#5 · Aperta il 4/9/2026
Empty Assays Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 65/100

lgatto/mulink-qfeatures#3 · Aperta il 4/9/2026
Comparing ai2025 before after h5mu export Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 64/100

lgatto/mulink-qfeatures#2 · 4 commenti · Aperta il 4/9/2026
plot(itraqdata2[[i]], s, main = s) issues warning Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 58/100

lgatto/MSnbase#613 · 2 commenti · Aperta il 8/4/2026
filterFile gives "object of type 'S4' is not subsettable" error Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

lgatto/MSnbase#611 · 1 commento · Aperta il 14/8/2025
Problem creating PXD object on the cluster Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

lgatto/rpx#30 · Aperta il 6/6/2025
Unable to use higher iterations and burnin for tagmMcmcTrain Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

lgatto/pRoloc#158 · 13 commenti · Aperta il 21/4/2025
compatibility with matrix of markers Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

lgatto/pRolocGUI#120 · Aperta il 14/3/2025
Deprecation of functions Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

lgatto/pRoloc#156 · 2 commenti · Aperta il 26/2/2025
Consider changing name of getMarkers() Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

lgatto/pRoloc#155 · Aperta il 9/1/2025
Update titles of datasets Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

lgatto/pRolocdata#76 · Aperta il 5/12/2024
A bug in reduce function Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 50/100

lgatto/MSnbase#607 · 1 commento · 1 reazione · Aperta il 15/11/2024
Add data from A549 cancer LOPIT Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

lgatto/pRolocdata#75 · Aperta il 4/10/2024
Modification of plot2D to allow filled characters Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 38/100

lgatto/pRoloc#152 · 4 commenti · Aperta il 4/10/2024
Moved content of inst/extdata to the pRolocdata dataverse Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

lgatto/pRolocdata#74 · 2 commenti · Aperta il 17/9/2024
MSnSet <-> SummarizedExperiment Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

lgatto/pRoloc#150 · 1 reazione · Aperta il 5/9/2024
invalid class “MIAPE” object: invalid object for slot "instrumentModel" in class "MIAPE": got class "list", should be or extend class "character" from Autotuner Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

lgatto/MSnbase#603 · 6 commenti · Aperta il 13/6/2024
Using PXD015169 data from PRIDE Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

lgatto/rpx#23 · 2 commenti · Aperta il 3/4/2023
FTP status was '550 Requested action not taken; file unavailable' Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 38/100

lgatto/rpx#21 · 14 commenti · Aperta il 2/3/2023
unit tests Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 15/100

lgatto/pRolocGUI#113 · Aperta il 30/9/2022
Add Cho cell data Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

lgatto/pRolocdata#71 · Aperta il 12/8/2022
Add support for more repos Aperta

enhancement

lgatto/rpx#20 · 2 reazioni · 1 assegnatario · Aperta il 10/8/2022
Add data from Valerio human keratinocytes Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 30/100

lgatto/pRolocdata#70 · Aperta il 7/4/2022
change map colours to be consistent with new shiny apps Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 20/100

lgatto/pRolocGUI#111 · Aperta il 25/1/2022
Add data from Olsen et al 2021 Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

lgatto/pRolocdata#69 · Aperta il 10/12/2021
Unexpected output from fDataToUnknown Aperta

lgatto/pRoloc#144 · 1 assegnatario · Aperta il 10/12/2021
New RNGseed in BiocParallel Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

lgatto/pRoloc#143 · Aperta il 9/10/2021
add CF LOPIT data Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

lgatto/pRolocdata#68 · Aperta il 6/10/2021
Issue with PXD012097 Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

lgatto/rpx#16 · Aperta il 6/10/2021
Issue with PXD010692 Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

lgatto/rpx#15 · Aperta il 5/10/2021
Issue with PXD012577 Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

lgatto/rpx#14 · Aperta il 5/10/2021
Issue with PXD012922 Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

lgatto/rpx#13 · Aperta il 5/10/2021
Issue with PXD012095 Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

lgatto/rpx#12 · Aperta il 4/10/2021
add data from Oom et al. HIV proteomics Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

lgatto/pRolocdata#67 · 1 reazione · Aperta il 9/9/2021
recalibration Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 15/100

lgatto/MSnbase#552 · 4 commenti · Aperta il 8/9/2021
Add data from Valerio UVA spatial proteomics Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

lgatto/pRolocdata#66 · Aperta il 7/9/2021
Issue with PXD000002 Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

lgatto/rpx#11 · Aperta il 16/8/2021
Google group rss feeds down Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

lgatto/rpx#7 · Aperta il 12/8/2021
add t-SNE coords to THP data Aperta

lgatto/pRolocdata#65 · 1 assegnatario · Aperta il 29/6/2021
add MDI clustering results to lps data Aperta

lgatto/pRolocdata#64 · 1 assegnatario · Aperta il 17/6/2021
Allow passing of predefined colours when loading pRolocGUI Aperta

enhancement

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

lgatto/pRolocGUI#107 · Aperta il 20/4/2021
Update vignette and videos Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 30/100

lgatto/pRolocGUI#106 · Aperta il 15/4/2021
add HIV1 infection data Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

lgatto/pRolocdata#63 · Aperta il 16/3/2021
tagmPredict compatibility with Novelty TAGM results Aperta

bug

lgatto/pRoloc#138 · 1 assegnatario · Aperta il 11/9/2020
remove redundant column in Barylyuk2020ToxoLopit Aperta

lgatto/pRolocdata#55 · 1 assegnatario · Aperta il 19/5/2020
New features Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

lgatto/pRolocGUI#97 · Aperta il 28/4/2020
Water loss for b-fragments? Aperta

Awaiting response

lgatto/MSnbase#472 · 2 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 31/5/2019
PCA plot aspect Aperta

lgatto/pRoloc#134 · 1 assegnatario · Aperta il 1/5/2019
Novelty Tagm ToDo Aperta

lgatto/pRoloc#127 · 2 assegnatari · Aperta il 10/12/2018

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