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include tile plot in DLC pipeline

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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python
Ambito
data, devops

Direzione di ricerca

Inizia leggendo IBL_video_tile_plot.py, quindi determina come la pipeline DLC possa ottenere i dati video pertinenti senza scaricarli manualmente. Il lavoro è completato quando viene generato quotidianamente un tile plot per ogni laboratorio e reso accessibile tramite il sito web di DJ o un'altra posizione concordata.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

enhancement

another point: it would be great to have a tile plot of video data for each lab in DJ website (or somewhere easily accessible to each) updated daily to check mouse positioning.
@Michael Schartner already did the coding for it: https://github.com/int-brain-lab/iblvideo/blob/master/IBL_video_tile_plot.py
However it currently requires one to download the relevant video data and run the tile script…
Could we have it automatically done, or is that too big of a job ?
Gaëlle

Lingua principale
Jupyter Notebook
Stelle
3
Fork
9
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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