glmmTMB

Le issue su cui forse qualcuno sta già lavorando sono in fondo alla lista. Ordina tutto per data

• RTMB back end: simulate() fails with REML = TRUE

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  Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 65/100

  glmmTMB/glmmTMB#1358 · Aperta il 21/10/2026

• RTMB back end: simulate() ignores the rr() loadings

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  glmmTMB/glmmTMB#1357 · Aperta il 21/10/2026

• Feature request: unstructured covariance with identity diagonal (correlation-only structure)

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  glmmTMB/glmmTMB#1356 · 1 commento · Aperta il 16/10/2026

• `refit()` scoping issue.

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  glmmTMB/glmmTMB#1355 · Aperta il 15/10/2026

• profile = TRUE: document that standard errors are an approximation for non-Gaussian models

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  glmmTMB/glmmTMB#1349 · 2 commenti · Aperta il 2/10/2026

• fitTMB(doOptim = FALSE) is ignored when profile = TRUE

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  glmmTMB/glmmTMB#1347 · Aperta il 2/10/2026

• A distribution suitable for reaction times is lacking

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  glmmTMB/glmmTMB#1346 · 3 commenti · Aperta il 30/9/2026

• improve prediction types for ordered beta (family=ordbetareg)

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  glmmTMB/glmmTMB#1332 · 1 commento · 1 reazione · Aperta il 15/9/2026

• Feature request: support the loglog link function in beta_family()

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  glmmTMB/glmmTMB#1331 · 1 commento · Aperta il 14/9/2026

• Suspicious results when clustering SEs with vcovCR or vcovHC

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  glmmTMB/glmmTMB#1322 · Aperta il 20/8/2026

• allow print.VarCorr to report corr when `full_cor=FALSE` for cs() models?

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  glmmTMB/glmmTMB#1297 · Aperta il 10/7/2026

• Covariance-structure syntax requiring extra metadata or model-frame variables

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  glmmTMB/glmmTMB#1290 · Aperta il 17/6/2026

• limit phi (dispersion parameter) range for genpois family

  Forse di nuovo libera @mebrooks l’ha presa 154 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta

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  glmmTMB/glmmTMB#1283 · 1 assegnatario · Aperta il 20/5/2026

• Complete separation in binomial glmmTMB is causing degrees of freedom in car::Anova to go all wonky

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  glmmTMB/glmmTMB#1281 · 5 commenti · Aperta il 8/5/2026

• should we be dropping unused levels in grouping variables?

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  glmmTMB/glmmTMB#1278 · 1 commento · Aperta il 26/4/2026

• Implement Residual pseudo-likelihood (RSPL / REML-type PL) estimation for GLMMs

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  glmmTMB/glmmTMB#1273 · 1 commento · Aperta il 30/3/2026

• Strange structure from `simulate()` from Bernoulli outcomes (binomial family with binary response)

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  glmmTMB/glmmTMB#1262 · 1 commento · Aperta il 23/2/2026

• format_corr.vcmat_* methods for equalto, propto?

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  glmmTMB/glmmTMB#1252 · 10 commenti · Aperta il 26/12/2025

• Support for custom link functions?

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  glmmTMB/glmmTMB#1246 · 2 commenti · Aperta il 22/12/2025

• scaled gradient check for glmmTMB (lme4-like)

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  glmmTMB/glmmTMB#1241 · 3 commenti · Aperta il 7/11/2025

• Mapping param names between TMB/tmbstan and glmmTMB

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  glmmTMB/glmmTMB#1240 · 7 commenti · Aperta il 5/11/2025

• ddf inconsistency for model using homogeneous compound symmetry

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  glmmTMB/glmmTMB#1238 · 2 commenti · Aperta il 10/10/2025

• enable OSA residuals

  Forse di nuovo libera @mebrooks l’ha presa 436 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta

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  feature_request

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  glmmTMB/glmmTMB#1227 · 8 commenti · 1 reazione · Aperta il 12/8/2025

• Instrumental variable

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  glmmTMB/glmmTMB#1223 · 2 commenti · Aperta il 5/8/2025

• AR1 cross-platform (?) incompatibilities

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  glmmTMB/glmmTMB#1217 · Aperta il 20/7/2025

• non-comparability of hurdle-Gamma (etc) likelihoods/AICs to non-hurdle values

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  glmmTMB/glmmTMB#1216 · 3 commenti · 1 reazione · Aperta il 20/7/2025

• Standard error and covariance matrix of BLUPs conditioned on only one specific level of random effects?

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  glmmTMB/glmmTMB#1207 · 3 commenti · Aperta il 23/6/2025

• Confidence intervals for `rr` and/or biplot

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  glmmTMB/glmmTMB#1202 · Aperta il 25/5/2025

• Nesting a random factor in GLM(M)

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  glmmTMB/glmmTMB#1200 · 2 commenti · Aperta il 18/5/2025

• Output for ordbeta

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  glmmTMB/glmmTMB#1198 · Aperta il 13/5/2025

• tobit models?

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  glmmTMB/glmmTMB#1196 · 1 commento · Aperta il 1/5/2025

• storing (or not) large correlation matrices, corr printing

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  glmmTMB/glmmTMB#1188 · 1 commento · Aperta il 10/4/2025

• Bug in predict with re.form=NA and a smooth term

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  glmmTMB/glmmTMB#1181 · 1 commento · Aperta il 31/3/2025

• getME("theta") only returns theta for conditional model

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  glmmTMB/glmmTMB#1178 · Aperta il 25/3/2025

• compile problem affecting quick install

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  glmmTMB/glmmTMB#1171 · 4 commenti · Aperta il 11/3/2025

• why are we hacking the formula environment?

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  glmmTMB/glmmTMB#1170 · 8 commenti · Aperta il 8/3/2025

• Consistent Model Convergence Problems when `REML = TRUE`, but only on certain machines?

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  glmmTMB/glmmTMB#1169 · 18 commenti · Aperta il 7/3/2025

• message when family is implicitly set to gaussian?

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  glmmTMB/glmmTMB#1163 · Aperta il 25/2/2025

• Differences in estimates depending on ordering of data

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  glmmTMB/glmmTMB#1160 · 2 commenti · Aperta il 21/2/2025

• A toy example for documentation

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  glmmTMB/glmmTMB#1158 · 2 commenti · Aperta il 19/2/2025

• simulate_new will not simulate unless at least two levels of a factor are present

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  glmmTMB/glmmTMB#1157 · 2 commenti · 1 reazione · Aperta il 18/2/2025

• Predict function gives different link estimates than coefficient when REML=TRUE

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  glmmTMB/glmmTMB#1143 · 4 commenti · Aperta il 6/1/2025

• Strange confusing name of the ar1 effect in the summary() output

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  glmmTMB/glmmTMB#1140 · 1 commento · Aperta il 13/12/2024

• Question about an attempt to implement Kenward-Roger degrees of freedom

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  glmmTMB/glmmTMB#1139 · 12 commenti · 1 reazione · Aperta il 12/12/2024

• MCMC vignette

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  glmmTMB/glmmTMB#1130 · 10 commenti · Aperta il 28/11/2024

• Do priors contribute to the logLik output?

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  glmmTMB/glmmTMB#1116 · 7 commenti · 1 reazione · Aperta il 12/11/2024

• document page for all methods

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  glmmTMB/glmmTMB#1114 · Aperta il 9/11/2024

• rr() model + ranef(., condVar=TRUE) very slow?

  Forse di nuovo libera @bbolker l’ha presa 716 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta

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  glmmTMB/glmmTMB#1112 · 2 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 5/11/2024

• add family_params printing to summary() output

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  glmmTMB/glmmTMB#1109 · Aperta il 30/10/2024

• Auto-scaling fixef priors with the residual SD in Gaussian models

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  glmmTMB/glmmTMB#1105 · 6 commenti · Aperta il 16/10/2024