Progress bar only on sequential and multicore, missing on multisession and cluster
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 28/100
- Tipo di issue
- Bug
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Ferma
- Stack tecnologico
- r
- Ambito
- distributed-systems
Direzione di ricerca
Inizia con la riproduzione nel gist collegato e confronta progressr::handlers('debug') con i piani sequential, multisession, multicore e cluster. Traccia il motivo per cui gli aggiornamenti del progresso non vengono ricevuti in multisession/cluster e perché multicore segnala aggiornamenti dopo lo shutdown. Il lavoro è completato quando un caso minimo riproducibile si comporta in modo coerente con i piani segnalati, con output del progresso e senza avvisi spurii.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
I have incorporated progressr progressor into a fairly complex R package that uses %dofuture% to split large objects across workers.
The progress bar shows up when called under plan(sequential) or, in Linux, under plan(multicore), but fails to show up with either multisession or cluster. This happens both in Linux and Windows, the later tested on a clean R 4.5.2 installation. After setting multisession, handlers('debug') also fails to print any messages.
Running the examples in the 'progressr' package works without problem, so there might be something in our packages that is affecting the progressor. But the fact of only failing under some plans puzzles me.
I have placed example code under this gist. I am afraid it requires installation of quite a few packages.
On multicore we are getting warnings about some progression updates not being listened to, but running with 'debug' did not clarify what is wrong
> plan(multicore, workers=2)
> tes <- mp(om, oem=oem, ctrl=control, args=list(iy=2021, fy=2026))
Running on 2 nodes.
[08:51:13.790] (0.000s => +0.014s) initiate: 0/6 (+0) '' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
[08:51:13.791] (0.001s => +0.013s) update: 1/6 (+1) 'year: 2021' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
[08:51:14.776] (0.986s => +0.017s) update: 2/6 (+1) 'year: 2022' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
[08:51:15.728] (1.939s => +0.016s) update: 3/6 (+1) 'year: 2023' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
[08:51:18.644] (4.854s => +0.004s) update: 4/6 (+1) 'year: 2024' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
[08:51:19.646] (5.856s => +0.013s) update: 5/6 (+1) 'year: 2025' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
[08:51:20.696] (6.906s => +0.001s) shutdown: 6/6 (+1) 'year: 2025' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
[08:51:20.697] (6.907s => +0.002s) shutdown: 6/6 (+0) 'year: 2025' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
Warning: The global progression handlers received a progression ‘update’ request (amount=1; msg=‘year: 2024’), but is no longer listening to this progressor. This can happen when code signals more progress updates than steps in the progressor. To troubleshoot this, retry with progressr::handlers("debug")
Warning: The global progression handlers received a progression ‘update’ request (amount=1; msg=‘year: 2025’), but is no longer listening to this progressor. This can happen when code signals more progress updates than steps in the progressor. To troubleshoot this, retry with progressr::handlers("debug")
It does not happen with 'sequential'
> plan(sequential)
tes <- mp(om, oem=oem, ctrl=control, args=list(iy=2021, fy=2026))
TRACKER: .Random.seed changed
> tes <- mp(om, oem=oem, ctrl=control, args=list(iy=2021, fy=2026))
[08:50:46.784] (0.000s => +0.013s) initiate: 0/6 (+0) '' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
[08:50:46.850] (0.066s => +0.065s) update: 1/6 (+1) 'year: 2021' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
[08:50:51.621] (4.837s => +0.001s) update: 2/6 (+1) 'year: 2022' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
[08:50:53.994] (7.210s => +0.001s) update: 3/6 (+1) 'year: 2023' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
[08:50:55.918] (9.133s => +0.001s) update: 4/6 (+1) 'year: 2024' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
[08:50:58.667] (11.883s => +0.000s) update: 5/6 (+1) 'year: 2025' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
[08:51:01.272] (14.487s => +0.000s) shutdown: 6/6 (+1) 'year: 2025' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
[08:51:01.272] (14.488s => +0.001s) shutdown: 6/6 (+0) 'year: 2025' {clear=TRUE, enabled=TRUE, status=}
Any suggestions on what to check?
- Lingua principale
- R
- Stelle
- 299
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