common-workflow-language/cwl-utils

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• JS version detection does not parse alpha version correctly

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  common-workflow-language/cwl-utils#477 · 1 commento · Aperta il 16/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• feature: cwl-docker-extract --container-engine parameter

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  common-workflow-language/cwl-utils#475 · 1 commento · Aperta il 8/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Embedded process with a different cwlVersion rejected since 0.43 — should it be ignored instead?

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  Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

  common-workflow-language/cwl-utils#470 · 2 commenti · Aperta il 24/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• cwltool is selecting the wrong container in aarch64 PJM compute nodes of Fugaku HPC

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  common-workflow-language/cwl-utils#467 · 4 commenti · Aperta il 20/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Issue with Docker tag handling

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  common-workflow-language/cwl-utils#339 · 1 commento · Aperta il 5/12/2024

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• CWL steps given in alphabetical order rather than the order in the CWL file

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  common-workflow-language/cwl-utils#326 · Aperta il 19/10/2024

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• new command: cwl-summary

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  common-workflow-language/cwl-utils#314 · Aperta il 19/8/2024

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Proposal for a Function to Generate JSON Schema for Workflow Parameter Files

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  common-workflow-language/cwl-utils#273 · 3 commenti · Aperta il 14/1/2024

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Inconsistent `type` attribute in `CommandInputParameter`

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  common-workflow-language/cwl-utils#271 · Aperta il 19/12/2023

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• New tests needed to catch future regressions

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  common-workflow-language/cwl-utils#260 · Aperta il 13/11/2023

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• test & support apptainer in addition to singularity-ce

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  common-workflow-language/cwl-utils#185 · Aperta il 28/11/2022

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• test __eq__ & __hash__ with load/save of all CWL conformance tests

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  common-workflow-language/cwl-utils#168 · Aperta il 13/9/2022

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• docker_extract.py is not handling relative directories very well.

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  common-workflow-language/cwl-utils#157 · 1 commento · Aperta il 1/9/2022

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• [Feature Request] utility function to access nested fields

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  common-workflow-language/cwl-utils#106 · 1 commento · Aperta il 2/10/2021

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• new feature: implement cwltool --target / --single-{step,process} --print-{subgraph,target}

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  common-workflow-language/cwl-utils#92 · Aperta il 4/9/2021

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• Subtree of workflow is updated only to v1.1

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  common-workflow-language/cwl-utils#89 · Aperta il 12/7/2021

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• Documentation for importing packed files

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  common-workflow-language/cwl-utils#71 · 10 commenti · Aperta il 15/4/2021

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• Fix https://cwl-utils.readthedocs.io/

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  common-workflow-language/cwl-utils#57 · 7 commenti · Aperta il 9/2/2021

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• expr refactor new feature: consolidate generated `ExpressionTool`/`CommandLineTool`s

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  common-workflow-language/cwl-utils#49 · Aperta il 2/12/2020

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• expr refactor: download conformance tests and process & run them

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  common-workflow-language/cwl-utils#45 · Aperta il 12/11/2020

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• expr refactor: pickValue on a Workflow step input

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  common-workflow-language/cwl-utils#44 · Aperta il 12/11/2020

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• container image puller: consider using https://github.com/biowdl/prepull-singularity

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  common-workflow-language/cwl-utils#35 · 1 reazione · Aperta il 30/9/2020

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• schema_salad.exceptions.ValidationExceptions parsing certain data structures

  Forse di nuovo libera @leipzig l’ha presa 2232 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta

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  common-workflow-language/cwl-utils#31 · 12 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 4/9/2020

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• document release process

  Forse di nuovo libera @illusional l’ha presa 2319 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta

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  common-workflow-language/cwl-utils#22 · 3 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 13/6/2020

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• Request: tool to replace simple docker references with digests

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  common-workflow-language/cwl-utils#19 · 4 commenti · Aperta il 10/6/2020

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• teach cite_extract to generate a bibtex ".bib" bibliography

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  enhancement good first issue help wanted

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  common-workflow-language/cwl-utils#6 · Aperta il 12/7/2019

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• types for input/output not consistent

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  common-workflow-language/cwl-utils#2 · 1 commento · Aperta il 25/1/2019

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• add utilities to help with parsing CWL Parameter References

  Forse già presa @mr-c l’ha presa 1502 giorni fa. Aperta

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  common-workflow-language/cwl-utils#162 · Aperta il 8/9/2022

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