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Fork Pool Library Plates for MiniPCR

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python
Ambito
backend

Direzione di ricerca

Inizia tracciando i workflow esistenti di pooling shotgun e 16S nel backend Python e confronta il modo in cui sono rappresentate le relative strutture di piastre e pool. Definisci l’entry point MiniPCR e verifica come vengono gestiti 384 wells individuali o quattro sottopiastre da 96 wells, senza introdurre un passaggio di pool-of-pools. Il lavoro è completo quando entrambe le modalità di pooling supportate funzionano tramite il workflow MiniPCR.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

The MiniPCR workflow needs to support the pooling of some or all of 384 individual wells, or alternatively some or all of a 384 well plate as 4 96 well 'sub-plates'. MiniPCR is similar to shotgun, in that it does not require a pool of pools, the way 16S does; the backend of this fork should reflect that.

Lingua principale
Python
Stelle
2
Fork
15
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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