Pool amplicon libraries allows for 0 concentration triggering an exception
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Valutazione
- Difficoltà
- 3/5
- Tempo stimato
- 1-2 giorni
- Idoneità per principianti
- 42/100
Direzione di ricerca
Inizia dal gestore del modulo di pooling in labcontrol/gui/handlers/process_handlers/pooling_process.py e segui la richiesta fino a labcontrol/db/process.py intorno alla riga 2406, dove input_volume viene confrontato con 0.001. Riproduci l’input tramite la freccia verso il basso e analizza come la concentrazione diventa None. Il lavoro è completato quando il percorso per la concentrazione zero non attiva più l’eccezione segnalata.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
It's possible to select the down arrow when specifying a concentration. This results in the following exception:
AN ERROR HAS OCCURED!
Please copy the following into an issue in our github repository
Error
'<' not supported between instances of 'NoneType' and 'float'
Traceback
Traceback (most recent call last):
File "/Users/dtmcdonald/miniconda3/envs/labcontrol/lib/python3.7/site-packages/tornado/web.py", line 1697, in _execute result = method(*self.path_args, **self.path_kwargs)
File "/Users/dtmcdonald/miniconda3/envs/labcontrol/lib/python3.7/site-packages/tornado/web.py", line 3174, in wrapper return method(self, *args, **kwargs)
File "/Users/dtmcdonald/ResearchWork/software/labman/labcontrol/gui/handlers/process_handlers/pooling_process.py", line 310, in post {"function": "amplicon_pool", "parameters": {}})
File "/Users/dtmcdonald/ResearchWork/software/labman/labcontrol/db/process.py", line 2406, in create if in_comp['input_volume'] < 0.001:
TypeError: '<' not supported between instances of 'NoneType' and 'float'

- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 2
- Fork
- 15
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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