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Pool amplicon libraries allows for 0 concentration triggering an exception

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
42/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python
Ambito
backend

Direzione di ricerca

Inizia dal gestore del modulo di pooling in labcontrol/gui/handlers/process_handlers/pooling_process.py e segui la richiesta fino a labcontrol/db/process.py intorno alla riga 2406, dove input_volume viene confrontato con 0.001. Riproduci l’input tramite la freccia verso il basso e analizza come la concentrazione diventa None. Il lavoro è completato quando il percorso per la concentrazione zero non attiva più l’eccezione segnalata.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

bug priority:high

It's possible to select the down arrow when specifying a concentration. This results in the following exception:

AN ERROR HAS OCCURED!
Please copy the following into an issue in our github repository

Error
'<' not supported between instances of 'NoneType' and 'float'

Traceback
Traceback (most recent call last): 
File "/Users/dtmcdonald/miniconda3/envs/labcontrol/lib/python3.7/site-packages/tornado/web.py", line 1697, in _execute result = method(*self.path_args, **self.path_kwargs) 
File "/Users/dtmcdonald/miniconda3/envs/labcontrol/lib/python3.7/site-packages/tornado/web.py", line 3174, in wrapper return method(self, *args, **kwargs) 
File "/Users/dtmcdonald/ResearchWork/software/labman/labcontrol/gui/handlers/process_handlers/pooling_process.py", line 310, in post {"function": "amplicon_pool", "parameters": {}}) 
File "/Users/dtmcdonald/ResearchWork/software/labman/labcontrol/db/process.py", line 2406, in create if in_comp['input_volume'] < 0.001:
TypeError: '<' not supported between instances of 'NoneType' and 'float' 

poolpools_error

Lingua principale
Python
Stelle
2
Fork
15
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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