Running commands directly from Snakemake, not via splicekit shell
@grexor ci sta già lavorando.
Dal 4/3/2025.
Valutazione
Questa issue non è ancora stata valutata.
Descrizione
There are some parts in the Snakemake pipeline that use splicekit to run scripts (.sh) via splicekit, not directly via Snakemake shell; update these so also containerization is complete
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 23
- Fork
- 4
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
- Include un Dockerfile o un file Docker Compose
- Nessun modello di pull request
- Nessuna guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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