b
Nessuno ha ancora preso questa issue.
Valutazione
- Difficoltà
- 5/5
- Tempo stimato
- Più di una settimana
- Idoneità per principianti
- 5/100
- Tipo di issue
- Documentazione
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Tranquilla
- Stack tecnologico
- r
- Ambito
- bioinformatics
Direzione di ricerca
The issue title is only "b" and the body is a Mermaid flowchart of an E. coli fluctuation-assay protocol (R/Shinyflan analysis, μ = m/Nt, ANOVA), which has no relation to AGENTS.md. Nothing states what should change in this repository, and the single comment thread has been silent for six months. First step is to ask a maintainer whether this is intentionally filed at all; unless it is retitled and scoped to a concrete file, it is not actionable.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
flowchart TB
%% Styles professionnels
classDef start fill:#e3f2fd,stroke:#1976d2,stroke-width:3px
classDef stress fill:#fff3e0,stroke:#f57c00,stroke-width:2px
classDef assay fill:#f3e5f5,stroke:#7b1fa2,stroke-width:2px
classDef analysis fill:#e8f5e8,stroke:#388e3c,stroke-width:3px
A["<b>🦠 E. coli K-12 MG1655</b><br/>Stock -80°C<br/>18% glycerol<br/><i>Day -1</i>"]:::start
A --> B["LB 3mL<br/>7h 37°C 120rpm<br/>OD₆₀₀ = 0.3<br/><i>Day 0 matin</i>"]
B --> C["DM + 80mg/L glucose<br/>10mL overnight<br/>Acclimatation<br/><i>Day 0 soir</i>"]
%% BRANCH PRE-STRESS
C --> D1["<b>🌊 STRESS EAU USÉE</b><br/>DM + 5% EU filtrée<br/>2h 37°C 120rpm<br/><i>Day 1 matin</i>"]:::stress
C --> D2["<b>CTRL Stress</b><br/>DM seul<br/>2h 37°C 120rpm"]:::stress
D1 --> E["<b>🚿 LAVAGE CRITIQUE</b><br/>3× centrifugation<br/>4000g 5min saline<br/>Nt_inoculum vérifié"]
D2 --> E
%% 2x2 FACTORIEL
E --> F1["<b>A : CTRL total</b><br/>DM<br/>20 cultures 1mL"]:::assay
E --> F2["<b>B : SIM pur</b><br/>DM + Stress EU<br/>20 cultures 1mL"]:::assay
E --> F3["<b>C : DAMP + Chimie</b><br/>DM + 5% EU<br/>20 cultures 1mL"]:::assay
E --> F4["<b>D : Stress + Matrice</b><br/>DM + 5% EU + Stress<br/>20 cultures 1mL"]:::assay
F1 --> G["<b>🔬 FLUCTUATION ASSAY</b><br/>96-well deep plate<br/>24h 37°C 250rpm<br/>V₀=1mL → V₂₄ₕ=0.9mL<br/><i>Day 1 soir → Day 2</i>"]:::assay
F2 --> G
F3 --> G
F4 --> G
G --> H1["<b>15 puits/condition</b><br/>Dilutions 10⁻⁵<br/>TA agar<br/>CFU → <b>Nt</b>"]:::analysis
G --> H2["<b>81 puits/condition</b><br/>TA + Rifampicine<br/>100µg/mL<br/>Surface 100% sèche<br/><b>Distribution rᵢ</b>"]:::analysis
H1 --> I["<b>Nt = CFU × 10⁵ × V₂₄ₕ/40µL</b><br/>Moyenne ×3 par condition"]
H2 --> J["<b>Distribution mutants</b><br/>r = [0,2,0,15,38,1,…]<br/>16-20 valeurs/condition"]
I --> K["<b>Shinyflan R-package</b><br/>flan::fluctuation.test()<br/>Maximum Vraisemblance<br/>Luria-Delbrück<br/><b>m = f(rᵢ)</b>"]:::analysis
J --> K
K --> L["<b>μ = m/Nt</b><br/>par locus/génération<br/>IC 95%<br/>4 valeurs μ_A,B,C,D"]:::analysis
L --> M["<b>ANOVA 2×2 factorielle</b><br/>μ ~ Stress × Matrice<br/>TukeyHSD post-hoc<br/>p < 0.05"]:::analysis
%% Légende
M --> N["<b>HYPOTHÈSES :</b><br/>B>A : SIM induit<br/>C>A : Effet matrice<br/>D>B+C : Interaction<br/><i>5 jours total</i>"]
%% Liens publication
linkStyle 0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10 stroke:#1976d2,stroke-width:2px
- Lingua principale
- TypeScript
- Stelle
- 24.8k
- Fork
- 1.9k
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
Altre issue di agentsmd/agents.md
-
Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 75/100
-
openai/codex & PlutoLang/Pluto removed AGENTS.mdForse di nuovo libera @vincedprime l’ha presa 36 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 78/100
-
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100
-
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 68/100
-
Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 68/100
Tutte le issue di agentsmd/agents.md
Issue simili
-
idea-scout idea:453
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 83/100
jeanibarz/agent-notebook#453 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
-
level/task
Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 95/100
wazuh/wazuh-dashboard-plugins#9642 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
-
bug
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 91/100
unicef/adt-studio#1112 ·
I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni
-
feature request good first issue
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 88/100
TabularisDB/tabularis#1513 ·
I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni
-
Autocomplete still accepts an option after becoming disabledForse già presa @Xapollon430 l’ha presa oggi. Aperta
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 67/100
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno