VH-Lab/NDI-matlab

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• (Optional) Read byte ranges of cloud files, to allow sharded storage, e.g. for lightsheet viewing

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  VH-Lab/NDI-matlab#1028 · Aperta il 13/10/2026

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• Cloud CI never publishes its test results: cloud runners write no JUnit XML

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  VH-Lab/NDI-matlab#1026 · Aperta il 13/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Watching: ingest silently writes empty .nbf.tgz segments when MATLAB's tar/zip stop reading files

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  VH-Lab/NDI-matlab#1019 · Aperta il 3/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• readtimeseries on ndi.element.timeseries hangs in element-doc search, then fails opening vhsb with 'r'

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  VH-Lab/NDI-matlab#1018 · 1 commento · Aperta il 1/10/2026

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• Haley importer labels imageStack scale as micrometers, but values are pixels per mm

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  VH-Lab/NDI-matlab#1017 · Aperta il 1/10/2026

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• ontologyTableRowDoc2Table errors on ontologyTableRow documents without a document_id dependency

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  VH-Lab/NDI-matlab#1016 · 1 commento · Aperta il 1/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Downloaded dataset folders get marked as 'session' on first open, so ndi.dataset.dir refuses them

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  VH-Lab/NDI-matlab#1015 · 1 commento · Aperta il 1/10/2026

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• Dabrowska importer: Experiment 2 FPS data (17 animals) never imported

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  VH-Lab/NDI-matlab#1014 · 1 commento · Aperta il 1/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Francesconi/Dabrowska dataset: experiment003trial017 has a data record but no epochfiles_ingested record

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  VH-Lab/NDI-matlab#1013 · Aperta il 1/10/2026

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• How do pyramids change in V_eta?

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  VH-Lab/NDI-matlab#1007 · Aperta il 23/9/2026

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• ndi.cloud.authenticate silently uses the first organization for multi-org users

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  VH-Lab/NDI-matlab#1005 · Aperta il 22/9/2026

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• Deprecate `ndi.app.oridirtuning` in favor of `ndi.calc.vis.oridir_tuning`

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  VH-Lab/NDI-matlab#1001 · Aperta il 20/9/2026

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• extract_docs_files: staged file-series member copies (and the temp dir) leak on success in copy mode

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  VH-Lab/NDI-matlab#1000 · Aperta il 19/9/2026

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• Make ndi.common.PathConstants.TempFolder configurable at runtime

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  VH-Lab/NDI-matlab#999 · Aperta il 19/9/2026

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• File readers and GUIs should handle glacier-storage data gracefully (not just "file not found")

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  VH-Lab/NDI-matlab#996 · Aperta il 16/9/2026

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• GUI for managing document storage tiers (glacier ↔ standard)

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  VH-Lab/NDI-matlab#995 · Aperta il 16/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Feature: Allow the light sheet ingestion to proceed directly into the cloud

  Forse di nuovo libera @stevevanhooser l’ha presa 34 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta

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  VH-Lab/NDI-matlab#983 · 1 assegnatario · Aperta il 12/9/2026

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• Export a bin1-only .gef (and .h5ad) back out of the documents

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  VH-Lab/NDI-matlab#980 · Aperta il 9/9/2026

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• Multipart upload: single-file uploads are capped at 5 GB and fail late

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  VH-Lab/NDI-matlab#978 · Aperta il 9/9/2026

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• `ndi.element` should reject whitespace in `name` and `type`

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  VH-Lab/NDI-matlab#976 · Aperta il 8/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• minor `syncTriggerTrains`: the seed for a candidate offset is anchored at pulse 1, not at the fingerprint that produced it

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  VH-Lab/NDI-matlab#975 · Aperta il 8/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Does updateObjectTypeMarker miss a dataset whose session_in_a_dataset belongs to another session?

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  VH-Lab/NDI-matlab#974 · Aperta il 8/9/2026

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• Note: the ndi-documents signed-url-set JOB route has never been called against a live server

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  VH-Lab/NDI-matlab#971 · Aperta il 7/9/2026

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• Refactor spatialGeneExpressionTiles onto DID file series (and number members from 1)

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  VH-Lab/NDI-matlab#938 · Aperta il 6/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• ExtracellularInfoTest/testReturnsImportedNeurons fails (verification) in the No-Cloud test suite

  Forse di nuovo libera @stevevanhooser l’ha presa 59 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta

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  VH-Lab/NDI-matlab#878 · 1 assegnatario · Aperta il 18/8/2026

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• Add a deterministic close()/delete() to the SQLite database object (root-cause for #870)

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  VH-Lab/NDI-matlab#873 · 1 commento · Aperta il 13/8/2026

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• Add imageseries acquisition/ingest/read machinery to NDI 1 (image daq.system + daq.reader + element/probe)

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  VH-Lab/NDI-matlab#823 · Aperta il 10/6/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Batched multi-neuron spike-time reads for a single epoch (avoid per-element readtimeseries

  Forse di nuovo libera @stevevanhooser l’ha presa 134 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta

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  VH-Lab/NDI-matlab#822 · 1 assegnatario · Aperta il 5/6/2026

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• Add an optional array of external programs to the `app` document (provenance for external import pipelines)

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  VH-Lab/NDI-matlab#820 · Aperta il 5/6/2026

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• [did2 #16] Pre-release checklist: V_delta → V2 rename, test audit, real-work exploration

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  VH-Lab/NDI-matlab#804 · Aperta il 25/5/2026

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• [ndi-cloud-node] e2e tests for the dataset write-lock API (follow-up to #784)

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  VH-Lab/NDI-matlab#794 · Aperta il 19/5/2026

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• [did2 #774c] Deprecate src/ndi/ndi_common/schema_documents/ in favor of the DID-schema loader

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  VH-Lab/NDI-matlab#789 · Aperta il 19/5/2026

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• [did2 #15] Release notes, deprecation timeline, version bump

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  VH-Lab/NDI-matlab#788 · Aperta il 19/5/2026

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• [did2 #14] Migration guide (user-facing docs)

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  VH-Lab/NDI-matlab#787 · Aperta il 19/5/2026

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• [did2 #13] Cross-version cloud test: old NDI + new NDI on the same dataset

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  VH-Lab/NDI-matlab#786 · Aperta il 19/5/2026

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• [did2 #12] Corpus end-to-end tests for the migration path

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  VH-Lab/NDI-matlab#785 · Aperta il 19/5/2026

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• [did2 #11] [ndi-cloud-node] Dataset writeLock: exclusive write lease + 423 rejection

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  VH-Lab/NDI-matlab#784 · Aperta il 19/5/2026

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• [did2 #9] ndi.migrate.local: migrate a local dataset/session to V_delta

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  VH-Lab/NDI-matlab#782 · Aperta il 19/5/2026

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• metadata editor - open minds has changed dataset fields, author no longer there, instead contribution, and contributorAffiliation

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  VH-Lab/NDI-matlab#768 · Aperta il 4/5/2026

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• check openMinds 5.0 -- some instance names have changed (the leading url)

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  VH-Lab/NDI-matlab#767 · Aperta il 4/5/2026

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• Update calc docs so it finds document superclasses correctly

  Forse di nuovo libera @stevevanhooser l’ha presa 206 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta

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  VH-Lab/NDI-matlab#722 · 1 assegnatario · Aperta il 24/3/2026

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• ndi.cloud.internal.getCloudDatasetIdForLocalDataset should be easier to find

  Forse di nuovo libera @stevevanhooser l’ha presa 269 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta

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  VH-Lab/NDI-matlab#633 · 1 assegnatario · Aperta il 21/1/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• add a delete session and delete dataset method

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  VH-Lab/NDI-matlab#630 · 1 assegnatario · Aperta il 21/1/2026

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• epochProbeMapMaker - needs to have epoch Group number instead of rowname

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  VH-Lab/NDI-matlab#437 · Aperta il 29/8/2025

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• ndi.ontology.clearCache not clearing oboDataCache

  Forse di nuovo libera @stevevanhooser l’ha presa 446 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta

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  VH-Lab/NDI-matlab#425 · 1 assegnatario · Aperta il 28/7/2025

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• Database branch name hardcoded to "a" in ndi.database.implementations.database.didsqlite

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  VH-Lab/NDI-matlab#316 · Aperta il 13/3/2025

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• Impove performance when retrieving time series for set of epochs

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  VH-Lab/NDI-matlab#308 · 4 commenti · Aperta il 7/1/2025

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• question: should epoch-ids be enumerated instead of random stings of numbers?

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  VH-Lab/NDI-matlab#307 · Aperta il 16/12/2024

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• property lists

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  VH-Lab/NDI-matlab#289 · Aperta il 2/10/2024

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• adjust code so that more items are represented as properties

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