ReproNim/containers

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Containers "distribution" for reproducible neuroimaging

Stelle: 32
Fork: 17
Issue aperte per principianti: 0
Issue indicizzate: 42
Merge medio: 12h 2m
PR unite (30g): 3

Lingua principale: Python
Licenza: Apache-2.0
Ultimo push su GitHub: 18/9/2026
Ultima indicizzazione: 20/9/2026
Guida per i contributori: Nessuna guida per i contributori
Codice di condotta: Nessun codice di condotta
Label per principianti: Nessuna label per principianti indicizzata

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

42 issue aperte indicizzate

Add "bindpaths" configuration Aperta

ReproNim/containers#171 · 1 assegnatario · Aperta il 14/9/2026
download_url gives no retry and a confusing, redundantly-nested error on large-file IncompleteRead/connection-reset failures Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

ReproNim/containers#169 · Aperta il 14/9/2026
Check/fixup/extend support for building from other docker registries Aperta

ReproNim/containers#160 · 1 reazione · 2 assegnatari · Aperta il 23/4/2026
slow download through git-annex from datasets.datalad.org Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

ReproNim/containers#155 · Aperta il 30/12/2025
Add AIND containers Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

ReproNim/containers#144 · 1 commento · Aperta il 8/8/2025
need to bind mount .git/annex folder targets of ephemeral clones Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

ReproNim/containers#134 · Aperta il 20/12/2024
bibsnet fails Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

ReproNim/containers#127 · Aperta il 18/7/2024
flake: README example mriqc script, RuntimeError: Xvfb did not start Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

ReproNim/containers#125 · 2 commenti · Aperta il 5/6/2024
Add rudimentary testing of executability for freshly added containers Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

ReproNim/containers#120 · Aperta il 24/5/2024
Fails while running on OSX Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

ReproNim/containers#119 · 3 commenti · Aperta il 23/5/2024
Add "etelemetry" to singularity_cmd Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

ReproNim/containers#116 · Aperta il 22/5/2024
Provide neurodesk convenience command Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

ReproNim/containers#113 · Aperta il 18/4/2024
Establish collection of health checks Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

ReproNim/containers#112 · 1 commento · Aperta il 8/4/2024
Add option for "--bind" when running containers Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

ReproNim/containers#111 · 2 commenti · Aperta il 6/4/2024
Investigate CDI support Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

ReproNim/containers#95 · Aperta il 8/5/2023
Make testing actually test the version of this dataset as provided in PR Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

ReproNim/containers#89 · Aperta il 23/3/2023
JOSS paper Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

ReproNim/containers#85 · 1 commento · Aperta il 20/2/2023
Warning in output: Set MPLCONFIGDIR when running bids-mriqc Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 42/100

ReproNim/containers#83 · 4 commenti · Aperta il 7/2/2023
Go through the typical workflow and "relate" to reproman workflow Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

ReproNim/containers#79 · 3 commenti · Aperta il 1/2/2023
Add fmriprep-fake BIDS-App container Aperta

ReproNim/containers#77 · 1 reazione · 1 assegnatario · Aperta il 21/10/2022
Add containers for ABCD apps Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

ReproNim/containers#74 · 2 commenti · Aperta il 15/9/2022
"Semantic" shim to provide "ReproNim"ification of outputs Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

ReproNim/containers#70 · Aperta il 30/6/2022
Support M1 (arm64) Macs Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

ReproNim/containers#67 · 3 commenti · Aperta il 23/5/2022
Robustify deployment or script to not produce broken singularity images Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

ReproNim/containers#66 · Aperta il 6/1/2022
Allow for setting to map PWD into consistent path inside container Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

ReproNim/containers#63 · Aperta il 10/12/2021
prototypical example fails on a fresh NITRC-CE EC2 instance: BIDS root does not exist Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

ReproNim/containers#53 · Aperta il 15/12/2020
special treatment to stop underlying docker container if running via shim? Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

ReproNim/containers#52 · Aperta il 10/12/2020
"Typical workflow" observations on Windows Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

ReproNim/containers#50 · Aperta il 10/11/2020
Use docker images support in datalad-container to construct(/run?) our docker shim Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 10/100

ReproNim/containers#49 · Aperta il 29/10/2020
script to mirror all versions of containers from docker hub Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

ReproNim/containers#48 · 13 commenti · Aperta il 27/10/2020
bids/hcppipelines does not expose entrypoint, when original docker container does Aperta

ReproNim/containers#35 · 1 commento · 1 assegnatario · Aperta il 8/1/2020
Quick help on container output Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 25/100

ReproNim/containers#34 · Aperta il 12/12/2019
Add https://github.com/ml-tooling/ml-workspace Aperta

containers

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

ReproNim/containers#32 · 2 commenti · Aperta il 30/10/2019
FOI: bats-assert Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

ReproNim/containers#29 · 1 commento · Aperta il 7/8/2019
trouble running singularity in sanitized environment under /home or /tmp subdirectories Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 15/100

ReproNim/containers#23 · 1 commento · Aperta il 18/7/2019
Ability to get new containers while having all prior or used containers frozen to specific version Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

ReproNim/containers#8 · 5 commenti · Aperta il 8/5/2019
Prototypical workflow #1 Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 22/100

ReproNim/containers#7 · 3 commenti · Aperta il 8/5/2019
Add boutiques Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

ReproNim/containers#6 · Aperta il 3/5/2019
Deploy "cron" job somewhere to bring in updates automatically Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

ReproNim/containers#5 · Aperta il 3/5/2019
Establish testing of containerized apps Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

ReproNim/containers#4 · 2 commenti · Aperta il 2/5/2019
add repronim/ and other additional commonly used images Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

ReproNim/containers#2 · Aperta il 26/4/2019
Add docker images Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

ReproNim/containers#1 · Aperta il 23/4/2019

ReproNim/containers

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