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maisi unconditioned inference return noise

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
jupyter-notebook, python, pytorch
Ambito
machine-learning

Direzione di ricerca

Iniziare con scripts/diff_model_infer.py e il MAISI inference tutorial notebook, riproducendo la ricostruzione in un passaggio che produce rumore. Confrontare l’architettura di inferenza e la configurazione caricata con l’implementazione dell’addestramento, incluse le differenze discusse in issue 7991. Il lavoro è completato quando l’inferenza o la ricostruzione non condizionata non restituisce più un output rumoroso con le impostazioni fornite.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Hallo,

I tried longer to make the diffusion unet (rectified flow version) work but without success. the VAE performes correct and encoding and reconstruction look fine. I take all the configs from the repo so configuration as well as weights are equivalently loaded as in https://github.com/Project-MONAI/tutorials/blob/main/generation/maisi/maisi_inference_tutorial.ipynb.

Using the diffusion unet with the existing code of diffusion_model_infer.py with

from scripts.diff_model_infer import run_inference
data = run_inference(
  args,
  device,
  autoencoder,
  diffusion_unet,
  1.4,#scale_factor,
  None,#top_region_index_tensor,
  None, #bottom_region_index_tensor,
  torch.tensor([[1.5,1.5,4.0]]).to('cuda'),#spacing_tensor,
  torch.tensor([1]).to('cuda'),#modality_tensor,
  (96,96,96),#output_size,
  4,
  logger,
)

I saw that there was an issue with the architecture which was different during training and the implementation but I'm not sure if that is related.
https://github.com/Project-MONAI/MONAI/issues/7991.
Some observations I made is when I would like to just reconstruction an image and basically make one step, the recon get's extremly noise.

For any suggestion what could be the potential issue, I'm thankful.

Best,
Lukas

Lingua principale
Jupyter Notebook
Stelle
2.5k
Fork
803
Merge medio
6g 22h
PR unite (30g)
3

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Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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