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Wrong dimensions in `condition` bits does not throw error

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Valutazione

Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
45/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Specificata chiaramente
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
java
Ambito
backend

Direzione di ricerca

Riproduci il problema con l’esempio XML di NeuroML, concentrandoti sulle espressioni di condizione e di valore nella ConditionalDerivedVariable. Traccia la validazione delle dimensioni di jLEMS per tali espressioni e aggiungi una copertura che mostri che entrambe le incompatibilità generano errori; il lavoro è completato quando l’esempio fornito non passa più silenziosamente.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

bug 
<neuroml xmlns="http://www.neuroml.org/schema/neuroml2"  xmlns:xs="http://www.w3.org/2001/XMLSchema" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.neuroml.org/schema/neuroml2 https://raw.github.com/NeuroML/NeuroML2/development/Schemas/NeuroML2/NeuroML_v2.3.1.xsd" id="kd3">
    <ionChannelHH id="kd3" species="K" conductance="10 pS">
        <annotation/>
        <gate id="n" instances="1" type="gateHHrates">
            <q10Settings type="q10ExpTemp" q10Factor="3" experimentalTemp="16 degC"/>
            <forwardRate type="HHNearlyExpLinearRate" rate="0.02 per_ms" midpoint="20 mV" scale="9 mV"/>
            <reverseRate type="HHNearlyExpLinearRate" rate="-0.002 per_ms" midpoint="20 mV" scale="-9 mV"/>
        </gate>
    </ionChannelHH>
    <ComponentType name="HHNearlyExpLinearRate" extends="baseHHRate" description="A HHExpLinearRate, but not quite">
        <Parameter name="scale" dimension="voltage"/>
        <Parameter name="midpoint" dimension="voltage"/>
        <Parameter name="rate" dimension="per_time"/>
        <Dynamics>
            <DerivedVariable name="x" dimension="voltage" value="(v - midpoint)"/>
            <ConditionalDerivedVariable name="r" dimension="per_time" exposure="r">
                <!-- the condition below should throw an error, the value bit should also throw an error, dimensions are wrong in both places -->
                <Case condition="x .neq. 0" value="rate * x/(1 - exp(0 - x/scale))"/>
                <Case value="rate"/>
            </ConditionalDerivedVariable>
        </Dynamics>
    </ComponentType>
</neuroml>
Lingua principale
Java
Stelle
13
Fork
11
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

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