Error with Turing and ReverseDiff, adding matrices
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 45/100
Direzione di ricerca
Eseguire la Julia MWE e ispezionare il percorso che fallisce per l'addizione di matrici in ReverseDiff/src/derivatives/propagation.jl e src/derivatives/linalg/arithmetic.jl, in particolare increment_deriv! e special_reverse_exec!. Confrontare le combinazioni di matrici funzionanti e quelle che falliscono, quindi verificare che il modello Turing esegua correttamente il campionamento con ReverseDiff senza il MethodError segnalato.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Hi -
I've been using ReverseDiff to run some models in Turing, and it appears a recent change from v1.7 to 1.8 has made my models stop working. I managed to narrow down the issue to a single line in the model, where I try to add two matrices. Oddly, it only seems to be an issue with particular combinations of matrices, but I'm not seeing the pattern, so I'm not sure what the problem is.
See MWE below:
using Turing, ReverseDiff
@model function efa(P)
λ ~ filldist(Normal(0, 10), P, 1)
Ψ ~ filldist(truncated(Normal(0, 5), 0, Inf), P)
f_var ~ filldist(truncated(Normal(0, 5), 0, Inf), 1)
Σ1 = λ * f_var * λ' + Diagonal(Ψ) # Fails
# Σ1 = λ * f_var * λ' + diagm(Ψ) # Fails
# Σ1 = randn(P, P) + Diagonal(Ψ) # Works
# Σ1 = λ * f_var * λ' + randn(P, P) # Works
# Σ1 = λ * f_var * λ' + Diagonal(ones(P)) # Works
end
Turing.setadbackend(:reversediff)
efa_test = efa(3)
@time m1 = sample(efa_test, NUTS(1, 0.65), MCMCThreads(), 1, 4)
Running this gives an error like this (only the first few lines of the stacktrace shown):
nested task error: MethodError: no method matching increment_deriv!(::Float64, ::Float64)
Closest candidates are:
increment_deriv!(::ReverseDiff.TrackedArray, ::Real, ::Any) at C:\Users\opus\.julia\packages\ReverseDiff\60noS\src\derivatives\propagation.jl:34
increment_deriv!(::AbstractArray, ::Real, ::Any) at C:\Users\opus\.julia\packages\ReverseDiff\60noS\src\derivatives\propagation.jl:36
increment_deriv!(::AbstractArray, ::Any) at C:\Users\opus\.julia\packages\ReverseDiff\60noS\src\derivatives\propagation.jl:38
...
Stacktrace:
[1] increment_deriv!
@ ~\.julia\packages\ReverseDiff\60noS\src\derivatives\propagation.jl:35 [inlined]
[2] increment_deriv!(t::Matrix{Real}, x::Matrix{Float64})
@ ReverseDiff ~\.julia\packages\ReverseDiff\60noS\src\derivatives\propagation.jl:40
[3] special_reverse_exec!(instruction::ReverseDiff.SpecialInstruction{typeof(+), Tuple{ReverseDiff.TrackedArray{Float64, Float64, 2, Matrix{Float64}, Matrix{Float64}}, Matrix{Real}}, ReverseDiff.TrackedArray{Float64, Float64, 2, Matrix{Float64}, Matrix{Float64}}, Nothing})
@ ReverseDiff ~\.julia\packages\ReverseDiff\60noS\src\derivatives\linalg\arithmetic.jl:50
[4] reverse_exec!(instruction::ReverseDiff.SpecialInstruction{typeof(+), Tuple{ReverseDiff.TrackedArray{Float64, Float64, 2, Matrix{Float64}, Matrix{Float64}}, Matrix{Real}}, ReverseDiff.TrackedArray{Float64, Float64, 2, Matrix{Float64}, Matrix{Float64}}, Nothing})
@ ReverseDiff ~\.julia\packages\ReverseDiff\60noS\src\tape.jl:93
[5] reverse_pass!(tape::Vector{ReverseDiff.AbstractInstruction})
@ ReverseDiff ~\.julia\packages\ReverseDiff\60noS\src\tape.jl:87
[6] reverse_pass!
@ ~\.julia\packages\ReverseDiff\60noS\src\api\tape.jl:36 [inlined]
- Lingua principale
- Julia
- Stelle
- 396
- Fork
- 61
- Merge medio
- 23h 18m
- PR unite (30g)
- 16
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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