Circular foreign key references
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 30/100
Direzione di ricerca
Non sono indicati né un file di schema né un test. Inizia individuando le definizioni e i riferimenti di BLSample.blSubSampleId e DataCollection.strategySubWedgeOrigId, quindi esamina il loro utilizzo in DLS e riesegui il comando sqlacodegen. L'attività è completata quando sono documentati lo scopo e la decisione di rimuovere entrambe le colonne e sono state concordate le modifiche allo schema interessate.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Attempting to generate sqlalchemy models via sqlacodegen leads to the following warning/error:
sqlacodegen mysql+pymysql://user:password@host:port/ispyb_build --noinflect > models.py
/Users/rjgildea/software/cctbx_py3/conda_base/lib/python3.8/site-packages/sqlalchemy/sql/ddl.py:1213: SAWarning: Cannot correctly sort tables; there are unresolvable cycles between tables "BLSample, BLSampleImage, BLSubSample, DataCollection, Screening, ScreeningOutput, ScreeningStrategy, ScreeningStrategySubWedge, ScreeningStrategyWedge", which is usually caused by mutually dependent foreign key constraints. Foreign key constraints involving these tables will not be considered; this warning may raise an error in a future release.
util.warn(
This appears to be the result of two circular foreign key references:
BLSample -> BLSubSample -> BLSampleImage -> BLSample (via BLSample.blSubSampleId)
and
DataCollection -> screeningStrategySubWedge -> ScreeningStrategyWedge -> ScreeningStrategy -> Screening -> DataCollection (via DataCollection.strategySubWedgeOrigId).
As far as I can tell, both BLSample.blSubSampleId and DataCollection.strategySubWedgeOrigId appear to be unused at DLS. I don't understand what purpose either column serves. Can these columns be removed from the table?
- Lingua principale
- Shell
- Stelle
- 7
- Fork
- 13
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
- Include un Dockerfile o un file Docker Compose
- Nessun modello di pull request
- Leggi la guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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