Import of completed segmentations from other softwares
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Valutazione
- Difficoltà
- 5/5
- Tempo stimato
- Più di una settimana
- Idoneità per principianti
- 25/100
- Tipo di issue
- Funzionalità
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Stato di attività
- Ferma
- Ambito
- computer-vision
Direzione di ricerca
Inizia con la guida IMOD 3dmod e il tutorial collegato per verificare cosa contengono i file .mod e quali opzioni di esportazione sono disponibili. Confronta quindi questi output con le funzionalità esistenti di SuRVoS per l’importazione delle segmentazioni, se presenti. Il lavoro è completato quando si è importata una segmentazione .mod di IMOD in SuRVoS oppure si è documentato un formato di esportazione IMOD che SuRVoS è in grado di leggere.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
We've had a request to be able to import specifically .mod files from an IMOD segmentation.
My understanding (which may be flawed) of IMOD segmentations is that they are a series of model points that can then be "skinned" to display your segmentation in IMOD.
It would be good to either be able to read the output .mod file from IMOD into SuRVoS, or to be able to provide some guidance on how best to output the .mod file (or some other file) from IMOD that can then be read into SuRVoS.
Some potentially helpful resources:
YouTube tutorial for how to segment in IMOD: https://www.youtube.com/watch?v=BsNSVLIQ-cE
Written tutorial about segmenting in IMOD: https://bio3d.colorado.edu/imod/doc/3dmodguide.html#ViewingModel
Aha! Link: https://dls1.aha.io/features/D-21
- Lingua principale
- Cuda
- Stelle
- 25
- Fork
- 5
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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