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Should pyrenew's default MCMC sampler backend be numpyro's bundled NUTS sampler?

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python

Direzione di ricerca

Inizia leggendo la discussione nelle issue #361 e #151, quindi confronta i compromessi tra il sampler NUTS incluso in NumPyro e l’affidamento dell’inferenza a Bayeux o BlackJAX. La issue non indica file, test o un criterio di accettazione concreto; il lavoro sarebbe completato quando sarà stato concordato un backend predefinito e la decisione sarà stata documentata esplicitamente.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Or should the standard pattern be to specify the model in numpyro but pass it off to bayeux or blackjax etc for inference?

@CDCgov/pyrenew-devs

See also #361 #151

Lingua principale
Python
Stelle
30
Fork
11
Merge medio
6g 15h
PR unite (30g)
9

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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