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Making register() a generic

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
r
Ambito
tooling

Direzione di ricerca

Start by reading BiocParallel::register() and its internal registry machinery, then compare the existing BiocSingular::bsparam() behavior. Done means the project has an agreed mechanism for managing package-specific default Param objects through the registry without relying on separate global options.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

BiocNeighbors and BiocSingular follow BiocParallel's paradigm of using *Param objects to specify the algorithm and parameters to use for NN searching and SVD, respectively.

I have recently added a BiocSingular::bsparam() function that returns a "default" Param object, in much the same way that BiocParallel::bpparam() works. The idea is that developers can specify bsparam() in their functions/scripts and it will use a global default value that can be changed by the user. This is more convenient than passing the new Param explicitly to each function.

Currently, I am using a global options() to handle this, but it would be nice to use the BiocParallel::register() interface (and its internal machinery) to manage the setting and getting of the global default. One could imagine making register() an S4 generic, or even better, adding a simple mechanism that allows my packages to save to a different slot of the existing registry.

Lingua principale
R
Stelle
69
Fork
32
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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