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Hexbin & scatter plot performance

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
20/100
Tipo di issue
Documentazione
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
matplotlib, python

Direzione di ricerca

La issue nomina plt.hexbin e riporta i tempi per diversi numeri di punti e bin, ma non menziona alcun file del progetto, test o modifica al codice richiesta. Inizia riproducendo il benchmark descritto nella issue; per completarlo sarebbero necessari un’attività di performance o documentazione chiarita e una definizione di done concordata.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

When do scatter and hexbin plots start performing poorly?

A timing of plt.hexbin with random numbers showed that for points less than 10^6 the time remained roughly consistenly 200 ms. For 10^7, the time increased dramatically to 1.6 s. 10^8 took 12 s. The importance here is that the number of hexbin is consistent for all tests, thus the timing difference stems from binning.

One year of 1-minute measurements is approximately half a million points.

ChatGPT showed similar results:

Image

Now, let's consider the base case of 1 million points. How many bins are feasible?
100x100 bins is fast: 400 ms. 200x200 bins is ok: 1s. 1000x1000 bins is slow: 15s. Note that the difference in number of bins is 100 and not 10 as they are multiplied.

Conclusion

Hexbin is definitely suitable for 1 minute or 1 second data points. The default of 100x100 hexbins is a good option.

Lingua principale
Python
Stelle
1
Fork
2
Merge medio
17h 36m
PR unite (30g)
4

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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