AllenCell/tfe-data

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example scripts and utilities for preparing data for the time series colorizer app

Stelle: 4
Fork: 1
Issue aperte per principianti: 1
Issue indicizzate: 19
Merge medio: 3g 11h
PR unite (30g): 5

Lingua principale: Python
Licenza: Nessun dato sulla licenza
Ultimo push su GitHub: 19/9/2026
Ultima indicizzazione: 20/9/2026
Guida per i contributori: Nessuna guida per i contributori
Codice di condotta: Nessun codice di condotta
Label per principianti: Nessuna label per principianti indicizzata

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

Load files from parent folders in `tfe-open` Aperta

internals new feature

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

AllenCell/tfe-data#110 · 3 commenti · Aperta il 1/9/2026
Error when calculating feature min/max Aperta

bug

AllenCell/tfe-data#108 · 1 commento · 1 assegnatario · Aperta il 6/3/2026
Inconsistency between 2D/3D centroid handling Aperta

bug

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

AllenCell/tfe-data#107 · 1 commento · Aperta il 13/2/2026
Add warning about dataset sharing when running `tfe-open`. Aperta

new feature

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 62/100

AllenCell/tfe-data#106 · Aperta il 28/1/2026
Graph data spec for lineages Aperta

new feature question

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

AllenCell/tfe-data#105 · 1 commento · Aperta il 27/11/2025
Specify a release number when running `tfe-open` Aperta

new feature

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

AllenCell/tfe-data#104 · Aperta il 25/11/2025
Use shutdown signals in `tfe-open` Aperta

new feature

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

AllenCell/tfe-data#103 · Aperta il 24/11/2025
Auto-generate docs Aperta

documentation

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

AllenCell/tfe-data#94 · 1 commento · Aperta il 12/9/2025
Allow bounding box data to be passed in instead of calculated automatically Aperta

new feature

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100

AllenCell/tfe-data#79 · Aperta il 6/2/2025
Skip backdrop copy step when files already exist Aperta

new feature

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

AllenCell/tfe-data#71 · Aperta il 4/12/2024
Handle skipped frames in `converter.py` Aperta

bug

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

AllenCell/tfe-data#69 · Aperta il 3/12/2024
Add description field to backdrops Aperta

new feature

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

AllenCell/tfe-data#68 · Aperta il 3/12/2024
Converter API logging does not show frame progress Aperta

bug

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

AllenCell/tfe-data#67 · Aperta il 2/12/2024
Automated linting/formatting tests Aperta

internals new feature

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100

AllenCell/tfe-data#64 · 1 commento · Aperta il 25/11/2024
Idea: UI for converting datasets Aperta

dataset-management needs-detail new feature Potential Milestone

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

AllenCell/tfe-data#58 · 3 commenti · Aperta il 21/8/2024
Publish to PyPi Aperta

internals new feature

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 28/100

AllenCell/tfe-data#45 · 1 commento · Aperta il 10/4/2024
add conversion utility for TrackMate data Aperta

dataset-management new feature Potential Milestone

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

AllenCell/tfe-data#40 · 1 commento · Aperta il 20/3/2024
Downsampling for background images Aperta

new feature

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

AllenCell/tfe-data#27 · 1 commento · Aperta il 15/2/2024
Keep original segmentation filename when exporting frames? Aperta

new feature

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 38/100

AllenCell/tfe-data#24 · Aperta il 14/2/2024

AllenCell/tfe-data

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