tseemann/abricate

problem getting vfdb - Error 403

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#224 ouverte le 9 févr. 2026

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 (1 commentaire) (0 réaction) (1 personne assignée)Perl (105 forks)github user discovery
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Description

Got an error below when running on AWS, however, downloading the file manually is OK. Looks like the IP address is blocked somehow.

Setting up 'vfdb' in '/opt/conda/envs/nullarbor_env/db/vfdb'
Downloading: http://www.mgc.ac.cn/VFs/Down/VFDB_setA_nt.fas.gz
HTTP Result: 403
Destination: vfdb.fa.gz
Filesize:  bytes
gzip: vfdb.fa.gz: No such file or directory
load_fasta: vfdb.fa
load_fasta: read 0 unknown sequences
dedupe_seq: read 0 / kept 0

Guide contributeur

Direction de recherche
Vérifiez si l'URL nécessite un User Agent spécifique ou si l'adresse IP AWS est bloquée par le serveur. Examinez la fonction de téléchargement dans le code Perl pour voir comment les requêtes HTTP sont effectuées.
Stack technique
perl
Domaine
backend
Type d'issue
Bug
DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.
2
Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.
1-3 heures
Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.
Active
ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.
Claire
Prérequis
GitPerl
Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.
40