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rdk/3D-geometric-deep-learning-in-drugs

3D-geometric-deep-learning-in-drugs

Dernier commit 14 mars 2023

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rdk/AF2RankPython

Dernier commit 2 avr. 2022

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rdk/AHoJ-project

:wave: Webserver & command-line tool for search of APO (unbound) protein structures from HOLO (bound) forms and vice versa.

Dernier commit 3 nov. 2022

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rdk/Awesome-Bioinformatics

A curated list of awesome Bioinformatics libraries and software.

Dernier commit 11 janv. 2022

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rdk/BayesianOptimizationPython

A Python implementation of global optimization with gaussian processes.

Dernier commit 28 févr. 2017

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rdk/Cloud-BindJupyter Notebook

Cloud-based Drug Binding Structure Prediction

Dernier commit 16 déc. 2023

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rdk/Creality-Helper-Script-Wiki

Wiki for Creality Helper Script

Dernier commit 12 juil. 2024

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rdk/DFMDockJupyter Notebook

DFMDock (Denoising Force Matching Dock), a diffusion model that unifies sampling and ranking within a single framework.

Dernier commit 2 oct. 2024

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rdk/DeeplyToughPython

Dernier commit 28 août 2019

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rdk/DiffDock-PPPython

Implementation of DiffDock-PP: Rigid Protein-Protein Docking with Diffusion Models in PyTorch (ICLR 2023 - MLDD Workshop)

Dernier commit 30 avr. 2023

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rdk/DiffLinkerPython

DiffLinker: Equivariant 3D-Conditional Diffusion Model for Molecular Linker Design

Dernier commit 15 janv. 2024

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rdk/DoGSite3-Datasets

Here, we provide all datasets used for DoGSite binding site prediction performance analyses.

Dernier commit 15 juin 2023

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rdk/FastRandomForestJava

A fast implementation of the Random Forest algorithm for the Weka environment

Dernier commit 10 sept. 2017

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rdk/FasterForestJava

Fast Random Forests implementatios for Java.

Dernier commit 3 juin 2026

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rdk/FasterMolecularSurfaceJava

Java library with optimized implementation of NumericalSurfece from CDK

Dernier commit 5 juin 2026

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rdk/FlowDockPython

A geometric flow matching model for generative protein-ligand docking and affinity prediction. (ISMB 2025)

Dernier commit 7 avr. 2025

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rdk/GrASPPython

Dernier commit 28 juil. 2023

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rdk/HRMPython

Hierarchical Reasoning Model Official Release

Dernier commit 3 août 2025

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rdk/InsightManagerGroovy

A simplified wrapper for the Insight Java API

Dernier commit 24 févr. 2021

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rdk/JDTJava

Java Delaunay Triangulation

Dernier commit 18 mai 2012

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