linkml

Les issues sur lesquelles quelqu’un travaille peut-être déjà sont listées en dernier. Tout trier par date

• linkml-validate --config without positional data files validates nothing and reports success

  Ouverte

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  linkml/linkml#4227 · Ouverte le 6/11/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Make the kitchen sink exercise imports properly

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  linkml/linkml#4224 · 1 réaction · Ouverte le 6/11/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Rules cannot express non-Violation severity; ClassRule has no `severity`, every rule emits as Violation

  Ouverte

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  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

  linkml/linkml#4218 · Ouverte le 6/11/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• gen-shacl output churns thousands of lines when a class is added; existing shapes' content is unchanged

  Ouverte

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  bug

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 49/100

  linkml/linkml#4217 · Ouverte le 6/11/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Compile rules to SHACL Core `sh:or` instead of SPARQL pattern-matching

  Ouverte

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  bug

  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 45/100

  linkml/linkml#4216 · 1 commentaire · Ouverte le 6/11/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• gen-dbml duplicates slots

  Ouverte

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  community-generated

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100

  linkml/linkml#4127 · Ouverte le 13/10/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Minor tidyup in pythongen.py after two open PR merge

  Peut-être à nouveau libre @noelmcloughlin l’a pris il y a 29 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  community-generated generator-python

  linkml/linkml#4089 · 1 personne assignée · Ouverte le 8/10/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• dbGaP adapter: carry unit, bounds, comment and sentinel codes into the DD; fix crash on bare <value>

  Ouverte

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  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 42/100

  linkml/schema-automator#231 · Ouverte le 6/10/2026

• gen-owl silently drops `status` after the metamodel's status slot change

  Peut-être à nouveau libre @amc-corey-cox l’a pris il y a 30 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  linkml/linkml#4048 · 1 personne assignée · Ouverte le 1/10/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• linkml-model releases aren't reaching PyPI (trusted publishing fails)

  Peut-être à nouveau libre @kevinschaper l’a pris il y a 30 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  linkml/linkml#4045 · 2 commentaires · 1 personne assignée · Ouverte le 1/10/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• linkml-model: Regenerate or drop the JSON-LD native context behind Format.NATIVE_JSONLD

  Peut-être à nouveau libre @amc-corey-cox l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  metamodel

  linkml/linkml#4041 · 1 personne assignée · Ouverte le 30/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Fix `notes:` given as a scalar in linkml-model types.yaml

  Peut-être à nouveau libre @amc-corey-cox l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  metamodel

  linkml/linkml#4040 · 1 personne assignée · Ouverte le 30/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Underspecified `inlined_as_list` value when `inlined: False` and NO ID/KEY available

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug community-generated metamodel specification

  linkml/linkml#4026 · 2 personnes assignées · Ouverte le 22/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Underspecified `inlined: True` + `inlined_as_list: False` combination when NO ID/KEY available

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug community-generated metamodel specification

  linkml/linkml#4024 · 1 personne assignée · Ouverte le 22/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Underspecified `inlined: None` + `inlined_as_list: None` combination when ID/KEY available

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug community-generated metamodel specification

  linkml/linkml#4023 · 1 personne assignée · Ouverte le 22/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Underspecified `inlined: None` + `inlined_as_list: False` combination when ID/KEY available

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug community-generated metamodel specification

  linkml/linkml#4022 · 1 personne assignée · Ouverte le 22/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Clarify how to deal with `inlined: False` + `inlined_as_list: True` combination when ID/KEY available

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug community-generated loading metamodel specification

  linkml/linkml#4020 · 1 personne assignée · Ouverte le 22/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Underspecified `inlined: False` + `inlined_as_list: False` combination when ID/KEY available

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug community-generated metamodel specification

  linkml/linkml#4019 · 1 personne assignée · Ouverte le 22/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Specification: Annotation/SimpleDict/Any chaining ambiguity

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug specification

  linkml/linkml#4017 · 1 personne assignée · Ouverte le 22/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• `inapplicable` metaslot is not attached to any class, so the skip-logic how-to fails validation

  Peut-être à nouveau libre @amc-corey-cox l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  metamodel

  linkml/linkml#4014 · 1 commentaire · 1 personne assignée · Ouverte le 22/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Clean-up "Collection Forms" specification section

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug community-generated metamodel specification

  linkml/linkml#4012 · 1 réaction · 1 personne assignée · Ouverte le 21/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Clarify correctness of mention to `inlined_as_dict`

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug community-generated metamodel specification

  linkml/linkml#4011 · 4 commentaires · 1 personne assignée · Ouverte le 21/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Meta-model doesn't specify precedence between `inlined` and `inlined_as_list` when they conflict

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug community-generated metamodel specification

  linkml/linkml#4007 · 8 commentaires · 1 réaction · 1 personne assignée · Ouverte le 18/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Get more clarity on `inlined` and `inlined_as_list` logic and rules

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  metamodel specification

  linkml/linkml#4006 · 2 personnes assignées · Ouverte le 18/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Python generator fails for types with custom python base

  Peut-être à nouveau libre @kevinschaper l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug quick

  linkml/linkml#4005 · 1 personne assignée · Ouverte le 18/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Setting default_range edits imported schemas

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug specification

  linkml/linkml#3992 · 1 réaction · 1 personne assignée · Ouverte le 11/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Specification: Schemas may be valid only when imported

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug specification

  linkml/linkml#3988 · 2 réactions · 1 personne assignée · Ouverte le 11/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Validator is much too strict with `datetime`-typed slots, or `datetime` is underspecified

  Peut-être à nouveau libre @kevinschaper l’a pris il y a 37 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug community-generated generator-jsonschema specification

  linkml/linkml#3984 · 1 personne assignée · Ouverte le 10/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Add a type for binary data

  Peut-être à nouveau libre @gouttegd l’a pris il y a 58 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  community-generated enhancement specification

  linkml/linkml#3977 · 1 commentaire · 2 réactions · 1 personne assignée · Ouverte le 9/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Add a Scala generator

  Peut-être à nouveau libre @Ostrzyciel l’a pris il y a 58 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  community-generated linkml-scala

  linkml/linkml#3969 · 1 réaction · 1 personne assignée · Ouverte le 7/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Specification: Well-defined renaming

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 58 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  specification

  linkml/linkml#3968 · 4 commentaires · 1 personne assignée · Ouverte le 7/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Hook up logging to the global config

  Peut-être à nouveau libre @sneakers-the-rat l’a pris il y a 58 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  linkml/linkml#3959 · 1 personne assignée · Ouverte le 5/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• What are enums, really?

  Peut-être à nouveau libre @cmungall l’a pris il y a 58 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  specification

  linkml/linkml#3958 · 7 commentaires · 3 réactions · 1 personne assignée · Ouverte le 4/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Metamodel: Clarify the allowed values for enum is_a/mixin inheritance

  Peut-être à nouveau libre @kevinschaper l’a pris il y a 58 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug metamodel specification

  linkml/linkml#3957 · 2 commentaires · 1 réaction · 1 personne assignée · Ouverte le 4/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Remove the hbreader dependency

  Peut-être à nouveau libre @amc-corey-cox l’a pris il y a 58 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  linkml/linkml#3955 · 1 commentaire · 1 personne assignée · Ouverte le 3/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• linkml_files should own the w3id URL to vendored-path mapping

  Peut-être à nouveau libre @amc-corey-cox l’a pris il y a 58 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  linkml/linkml#3954 · 1 commentaire · 1 réaction · 1 personne assignée · Ouverte le 3/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Generated JSON-LD references an unresolvable core.context.jsonld

  Peut-être à nouveau libre @amc-corey-cox l’a pris il y a 58 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  linkml/linkml#3953 · 1 personne assignée · Ouverte le 3/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Specification: define inverse and the other relational metaslots

  Peut-être à nouveau libre @kevinschaper l’a pris il y a 58 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  documentation linkml-model needs discussion specification

  linkml/linkml#3952 · 1 réaction · 1 personne assignée · Ouverte le 2/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Two slots declaring the same inverse entails they are equivalent in OWL

  Peut-être à nouveau libre @kevinschaper l’a pris il y a 58 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug generator-owl needs discussion

  linkml/linkml#3951 · 1 personne assignée · Ouverte le 2/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• gen-owl silently drops five relational metaslots, and everything declared in slot_usage

  Peut-être à nouveau libre @kevinschaper l’a pris il y a 58 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug generator-owl

  linkml/linkml#3950 · 1 personne assignée · Ouverte le 2/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Dangling relational-metaslot references are not caught by anything

  Peut-être à nouveau libre @kevinschaper l’a pris il y a 58 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug linting metamodel

  linkml/linkml#3949 · 1 personne assignée · Ouverte le 2/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• SchemaView.inverse() drops conflicting matches and rejects its own annotated type

  Peut-être à nouveau libre @kevinschaper l’a pris il y a 58 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug linkml-runtime schemaview

  linkml/linkml#3948 · 1 personne assignée · Ouverte le 2/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Relational metaslots are under-specified, unenforced, gen-owl drops

  Peut-être à nouveau libre @kevinschaper l’a pris il y a 66 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  bug community-generated generator-misc linkml-model schemaview

  linkml/linkml#3940 · 1 commentaire · 1 personne assignée · Ouverte le 1/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Enable private vulnerability reporting and add a SECURITY.md

  Peut-être pris @matentzn l’a pris aujourd’hui. Ouverte

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  linkml/linkml#4223 · 1 personne assignée · Ouverte le 6/11/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Drop Python 3.10 support

  Peut-être pris @amc-corey-cox l’a pris aujourd’hui. Ouverte

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  linkml/linkml#4222 · 1 personne assignée · Ouverte le 6/11/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• Dependency audit fails PRs on advisories they did not introduce

  Peut-être pris @amc-corey-cox l’a pris aujourd’hui. Ouverte

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  linkml/linkml#4221 · 1 personne assignée · Ouverte le 6/11/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• gen-xxx ignores --no-mergeimports

  Peut-être pris @Rahul-cs50 l’a pris il y a 1 jour. Ouverte

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  bug

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

  linkml/linkml#4212 · Ouverte le 5/11/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• a `slot_usage` in another schema changes the URI of an induced slot

  Peut-être pris @noelmcloughlin l’a pris il y a 2 jours. Ouverte

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  bug schemaview

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

  linkml/linkml#4210 · Ouverte le 5/11/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• gen-sqltables logs "Unknown range base" errors for curie, objectidentifier and nodeidentifier slots

  Peut-être pris @Rahul-cs50 l’a pris aujourd’hui. Ouverte

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  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 83/100

  linkml/linkml#4209 · Ouverte le 4/11/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours

• A uri value ending with newline passes validation and reaches RDF output

  Peut-être pris @noelmcloughlin l’a pris il y a 2 jours. Ouverte

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  • Quelque chose ne va pas ?

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  bug

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 55/100

  linkml/linkml#4206 · Ouverte le 4/11/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours