eggnogdb

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  eggnogdb/eggnog-mapper#620 · 1 commentaire · Ouverte le 4/10/2026

• Pfam realign failing on eggnog mapper v3 beta 6

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  eggnogdb/eggnog-mapper#619 · Ouverte le 9/9/2026

• the run exited with the "INFO: gocryptfs not found, will not be able to use gocryptfs"

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  eggnogdb/eggnog-mapper#618 · 4 commentaires · 1 réaction · Ouverte le 8/9/2026

• COG_category output as numeric COG IDs instead of letters in v3

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  eggnogdb/eggnog-mapper#616 · 3 commentaires · 3 réactions · Ouverte le 1/9/2026

• Possible segmentation fault related to --algo 1

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  eggnogdb/eggnog-mapper#615 · Ouverte le 30/8/2026

• Unable to obtain MD5/SHA-256 checksum for downloaded database files

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  eggnogdb/eggnog-mapper#614 · 1 réaction · Ouverte le 29/8/2026

• selftest fail, diamond unable to terminate after end of eggnog-mapper run, and annotation RunTime error

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  eggnogdb/eggnog-mapper#613 · 1 commentaire · Ouverte le 25/8/2026

• download_eggnog_data.py in v3.0.0-beta6 fails in Apptainer: validates default backend path before honoring EGGNOG_DATA_DIR / --data_dir

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  eggnogdb/eggnog-mapper#612 · 2 commentaires · 1 réaction · Ouverte le 21/8/2026

• v3.0.0-beta6 decoration.py failure

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  eggnogdb/eggnog-mapper#611 · 1 commentaire · 1 réaction · Ouverte le 20/8/2026

• V3beta5: emapper.annotations output missing "map" prefix in KEGG_Pathway column

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  eggnogdb/eggnog-mapper#609 · Ouverte le 13/8/2026

• download_eggnog_data.py fails with 503 Service Unavailable behind institutional proxy

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  eggnogdb/eggnog-mapper#608 · 1 commentaire · Ouverte le 7/8/2026

• Python 3.8 has been EOL for 2 years

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  eggnogdb/eggnog-mapper#607 · 1 commentaire · Ouverte le 27/7/2026

• pip install does not work

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  eggnogdb/eggnog-mapper#606 · Ouverte le 1/7/2026

• v2.1.15 does not include the fixed URLs from v2.1.14

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  eggnogdb/eggnog-mapper#605 · Ouverte le 6/6/2026

• HTTP 404 Not Found when downloading EggNOG v7 in eggnog-mapper v3

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  eggnogdb/eggnog-mapper#604 · 10 commentaires · Ouverte le 25/5/2026

• What about the new EggNOG v7 version?

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  eggnogdb/eggnog-mapper#602 · 6 réactions · Ouverte le 8/5/2026

• Version in version.py still 2.1.13 for v2.1.14

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  eggnogdb/eggnog-mapper#601 · Ouverte le 5/5/2026

• 404 not found error when trying to download the eggnog database

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  eggnogdb/eggnog-mapper#600 · 3 commentaires · Ouverte le 28/4/2026

• Incomplete Descriptions in annotations file.

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  eggnogdb/eggnog-mapper#598 · Ouverte le 14/4/2026

• can't use pip install to install it in a server. Is it feasible by conda?

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  eggnogdb/eggnog-mapper#597 · 1 commentaire · Ouverte le 13/4/2026

• HTTPS certificate for web-interface

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  eggnogdb/eggnog-mapper#596 · 1 réaction · Ouverte le 30/3/2026

• database could not be download by using wiki download instruction

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  eggnogdb/eggnog-mapper#594 · 1 commentaire · Ouverte le 25/3/2026

• Annotation of .hits did suddenly stop working

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  eggnogdb/eggnog-mapper#593 · 3 commentaires · Ouverte le 19/3/2026

• 504 Gateway Time-out (nginx/1.29.1) when trying to access the EGGNog Mapper web

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  eggnogdb/eggnog-mapper#592 · 12 commentaires · 6 réactions · Ouverte le 26/2/2026

• Several errors - download_eggnog_data.py

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  eggnogdb/eggnog-mapper#590 · 6 commentaires · Ouverte le 23/1/2026

• Download URLs in download_eggnog_data.py Outdated (Downloads fail with 404 errors)

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  eggnogdb/eggnog-mapper#589 · 6 commentaires · 5 réactions · Ouverte le 2/1/2026

• Plan for supporting EggNOG v7 database?

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  eggnogdb/eggnog-mapper#588 · 6 commentaires · 26 réactions · Ouverte le 16/12/2025

• download_eggnog_data.py not working: ERROR 404: Not Found.

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  eggnogdb/eggnog-mapper#587 · 7 commentaires · Ouverte le 5/12/2025

• eggnog-mapper 504 Gateway Time-out

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  eggnogdb/eggnog-mapper#586 · 5 commentaires · Ouverte le 5/12/2025

• eggNOG-mapper is down please help

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  eggnogdb/eggnog-mapper#585 · 2 réactions · Ouverte le 4/12/2025

• Eggnog mapper to find orthologues

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  eggnogdb/eggnog-mapper#584 · Ouverte le 23/11/2025

• Issue Downloading EggNog databases

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  eggnogdb/eggnog-mapper#583 · Ouverte le 21/11/2025

• eggNOG-mapper online server has problem again

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  eggnogdb/eggnog-mapper#582 · 12 commentaires · Ouverte le 20/11/2025

• Different annotation for duplicate proteins in the same job

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  eggnogdb/eggnog-mapper#581 · Ouverte le 30/10/2025

• Error running diamond: Error: Invalid output field: scovhsp

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  eggnogdb/eggnog-mapper#580 · 1 commentaire · Ouverte le 29/10/2025

• No BIGG reaction results

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  eggnogdb/eggnog-mapper#579 · 2 commentaires · Ouverte le 21/10/2025

• Unable to run download_eggnog_data.py

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  eggnogdb/eggnog-mapper#578 · 3 commentaires · Ouverte le 18/10/2025

• Why Not Use the EggNOG6 Database?

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  eggnogdb/eggnog-mapper#577 · 9 réactions · Ouverte le 14/10/2025

• Download Link not Updated

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  eggnogdb/eggnog-mapper#575 · 1 commentaire · 5 réactions · Ouverte le 3/10/2025

• eggnog mapper web page not working

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  eggnogdb/eggnog-mapper#573 · 1 commentaire · Ouverte le 18/9/2025

• Speed up improvements

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  eggnogdb/eggnog-mapper#572 · 2 commentaires · 1 réaction · Ouverte le 12/9/2025

• cannot download databases

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  eggnogdb/eggnog-mapper#571 · 11 commentaires · Ouverte le 12/9/2025

• eggNOG-mapper job MM_yps932v4 finished, with status failed

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  eggnogdb/eggnog-mapper#570 · 6 commentaires · Ouverte le 12/9/2025

• Inconsistencies Between eggNOG COG Categories and Official COG Database

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  eggnogdb/eggnog-mapper#568 · 1 commentaire · Ouverte le 24/7/2025

• Empty Result When Using Novel families

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  eggnogdb/eggnog-mapper#566 · Ouverte le 24/7/2025

• eggnog mapper web page not working

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  eggnogdb/eggnog-mapper#565 · 1 commentaire · Ouverte le 6/7/2025

• eggnog application

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  eggnogdb/eggnog-mapper#564 · 1 commentaire · Ouverte le 1/7/2025

• run error about _psutil_linux

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  eggnogdb/eggnog-mapper#563 · Ouverte le 30/5/2025

• emapper.py: error: argument -i: invalid existing_file value: '/fs/ycs/ycs_metagenome/bin/output_files_7/metabat_bins/all_1.fa'

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  eggnogdb/eggnog-mapper#562 · Ouverte le 23/5/2025

• Mapper is returning obsolete EC numbers

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  eggnogdb/eggnog-mapper#561 · 1 commentaire · Ouverte le 21/5/2025