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Error in cf.write when writing UM data fields

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Évaluation

Difficulté
4/5
Temps estimé
3-5 jours
Accessibilité débutants
35/100
Type d'issue
Bug
Clarté
Plutôt claire
Activité
À l'abandon
Stack technique
python
Domaine
data

Piste de recherche

Reproduisez le problème avec le fichier UM et un exemple minimal de cf.read/cf.write. Commencez par cf/read_write/write.py et par le chemin cfdm netcdfwrite.py _write_global_attributes indiqué dans le traceback, puis déterminez pourquoi les valeurs des attributs globaux contiennent un dict non hachable. C’est terminé lorsque le champ UM s’écrit correctement sans cette TypeError.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Description

question um/pp

Hi folks. I'm encountering issues again with processing UM data. It's a related task to ticket #817 but a different error so I figured I'd start a new topic.

I can load in a single file (either on a surface level, UM tiles, or pressure levels) with no problem and perform usual cf-python tasks like amending and adding attributes, but when it comes to writing the file I get an unhashable type error as follows:

>>> cf.write(f[0], 'test.nc')
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/apps/jasmin/jaspy/miniforge_envs/jaspy3.11/mf3-23.11.0-0/envs/jaspy3.11-mf3-23.11.0-0-v20240815/lib/python3.11/site-packages/cfdm/decorators.py", line 171, in verbose_override_wrapper
    return method_with_verbose_kwarg(*args, **kwargs)
           ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  File "/apps/jasmin/jaspy/miniforge_envs/jaspy3.11/mf3-23.11.0-0/envs/jaspy3.11-mf3-23.11.0-0-v20240815/lib/python3.11/site-packages/cf/read_write/write.py", line 808, in write
    netcdf.write(
  File "/apps/jasmin/jaspy/miniforge_envs/jaspy3.11/mf3-23.11.0-0/envs/jaspy3.11-mf3-23.11.0-0-v20240815/lib/python3.11/site-packages/cfdm/decorators.py", line 171, in verbose_override_wrapper
    return method_with_verbose_kwarg(*args, **kwargs)
           ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  File "/apps/jasmin/jaspy/miniforge_envs/jaspy3.11/mf3-23.11.0-0/envs/jaspy3.11-mf3-23.11.0-0-v20240815/lib/python3.11/site-packages/cfdm/read_write/netcdf/netcdfwrite.py", line 4911, in write
    self._file_io_iteration(
  File "/apps/jasmin/jaspy/miniforge_envs/jaspy3.11/mf3-23.11.0-0/envs/jaspy3.11-mf3-23.11.0-0-v20240815/lib/python3.11/site-packages/cfdm/read_write/netcdf/netcdfwrite.py", line 5153, in _file_io_iteration
    self._write_global_attributes(fields)
  File "/apps/jasmin/jaspy/miniforge_envs/jaspy3.11/mf3-23.11.0-0/envs/jaspy3.11-mf3-23.11.0-0-v20240815/lib/python3.11/site-packages/cfdm/read_write/netcdf/netcdfwrite.py", line 4289, in _write_global_attributes
    force_global = {
                   ^
  File "/apps/jasmin/jaspy/miniforge_envs/jaspy3.11/mf3-23.11.0-0/envs/jaspy3.11-mf3-23.11.0-0-v20240815/lib/python3.11/site-packages/cfdm/read_write/netcdf/netcdfwrite.py", line 4292, in <dictcomp>
    if len(v) == len(fields) and len(set(v)) == 1
                                     ^^^^^^
TypeError: unhashable type: 'dict'

I've managed to process hourly and daily files with this workflow and v similar code with no problem so far. I've also double-checked that all the files I'm currently trying to process here are fully formed and compliant, so that's not the issue (I think this was the main problem in my previous ticket).

I have also tested this behaviour with a MWE, where I load a UM file and then try to write it to netcdf, and the same occurs, i.e.

f = cf.read('/path/to/file/UM_file')
cf.write(f[0], 'test.nc')

Can you help me understand what's going on here? I am able to save the fields in iris without a problem, so it doesn't seem to be packing or underlying file problem, but I'd like to use cf-python to maintain consistency with the other files I've post-processed with this method.

Langage dominant
Python
Étoiles
151
Forks
23
Merge moyen
1 j 2 h
PR mergées (30 j)
1

Préparer son environnement

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