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Add support for reading and writing WFDB files in cloud containers

Ouverte
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Évaluation

Difficulté
5/5
Temps estimé
Plus d'une semaine
Accessibilité débutants
25/100
Type d'issue
Fonctionnalité
Clarté
À clarifier
Activité
À l'abandon
Stack technique
python
Domaine
cloud

Piste de recherche

Commencez par retracer la manière dont rdrecord et les fonctions associées gèrent actuellement les chemins de fichiers. Examinez fsspec comme interface de système de fichiers proposée et déterminez l’étendue de la prise en charge de la lecture et de l’écriture de fichiers WFDB via des URI de conteneurs cloud. Le travail sera considéré comme terminé lorsque les cas d’utilisation pris en charge des systèmes de fichiers cloud seront définis et implémentés avec une couverture appropriée.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Description

Functions like rdrecord expect a direct path to a file be passed. Cloud services typically use URIs to point to files stored in cloud containers. When working in the cloud, simply passing the URI to functions like rdrecord will not work. A filesystem interface is required to handle backend requirements (like authentication and protocols).

Packages such as pandas and dask use fsspec. This filesystem interface allows using the same functions to read files from local, remote, or embeeded file systems.

We should consider integrating fsspec or something similar into the WFDB software.

Langage dominant
Jupyter Notebook
Étoiles
853
Forks
323
Métriques de merge des PR
Aucune PR mergée en 30 j

Préparer son environnement

Ce projet ne fournit ni conteneur de développement, ni Dockerfile, ni guide de contribution : l'installation est à votre charge. Commencez par son README, et consultez notre guide de la première contribution pour les étapes générales.

Par où commencer

  1. Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
  2. Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
  3. Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
  4. Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.

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