Bioconductor/GenomicFeatures

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• [Bug] Promoter intervals exceed chromosome boundaries on chrM (hg38)

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  Bioconductor/GenomicFeatures#73 · Ouverte le 21/8/2025

• Error in x$.self$finalize() : attempt to apply non-function

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  Bioconductor/GenomicFeatures#72 · Ouverte le 18/7/2025

• mirbase.db is out of date and is likely to be deprecated

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  Bioconductor/GenomicFeatures#71 · Ouverte le 6/3/2025

• `makeTxDbFromEnsembl` no longer connects to the right Ensembl database for Homo sapiens

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  Bioconductor/GenomicFeatures#69 · Ouverte le 20/9/2024

• How to import pseudogenes from GFF3 file as GRanges object?

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  Bioconductor/GenomicFeatures#68 · Ouverte le 10/4/2024

• mapToTranscripts reports incorrect regions when supplied GRangesList containing some empty transcripts

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  Bioconductor/GenomicFeatures#54 · 1 commentaire · Ouverte le 12/1/2023

• coverageByTranscript weights ?

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  enhancement

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  Bioconductor/GenomicFeatures#19 · 8 commentaires · Ouverte le 31/1/2020

• pmapFromTranscripts strange behaviour

  Peut-être à nouveau libre @mtmorgan l’a pris il y a 2824 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  Bioconductor/GenomicFeatures#10 · 12 commentaires · 1 personne assignée · Ouverte le 19/9/2018

• Make cdsBy(txdb, by="tx") return the CDS phase

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  Bioconductor/GenomicFeatures#9 · Ouverte le 14/8/2018